明末三大案是梃擊案、紅丸案和移宮案，這三起案件也稱爲晚明三大疑案。梃擊案發生在萬歷年間，張差持棍進宮行刺太子；紅丸案和移宮案發生在朱常洛執政時期，李選侍爲照顧朱由校進乾清宮，不久後朱常洛因服用紅丸而斃命，李選侍也被移到噦鸞宮。
這三起案件並沒有查清真相，後世也對此進行多種解讀，首先梃擊案兇手張差被抓，在審訊過程中張差供出與鄭貴妃有關，但萬曆皇帝十分寵愛鄭貴妃，只能凌遲張差來結束梃擊案，以保鄭貴妃不被牽連，所以這起案件沒有真相。
紅丸案是從李選侍進入乾清宮後發生的，當時朱常洛爲了強身健體服用紅丸，沒想到不久後便因過多服用紅丸而死。李選侍本來想和魏忠賢密謀居住乾清宮，以皇長子來控制明朝政權，但這件事被大臣們極力反對，最終李選侍只能移宮到噦鸞宮，然而四年後，李選侍被封爲了康妃，史稱移宮案，所以說這三件事是顛倒黑白。
