畸胎瘤由於部位各不相同、常有多種併發症和明顯的惡變趨勢，所以在臨床上可有各種症狀和表現：
①無痛性腫塊：這是畸胎瘤最常見的症狀，多為圓形囊性、邊界清楚、質地軟硬不勻，甚至可捫及骨性結節。其中外生性腫瘤以骶尾部、枕、額、鼻等中線部位常見，骶尾部畸胎瘤常可根據其所在位置分為顯型、隱型和混合型三種臨床型別。
②壓迫和腔道梗阻症狀：縱隔畸胎瘤常可壓迫呼吸道而引起嗆咳、呼吸困難及頸靜脈怒張；後腹膜畸胎瘤多有腹痛，並可引起腸梗阻。盆腔和骶尾部隱型畸胎瘤多因便祕、排便困難、尿瀦留而就診。
③腫瘤異常變化的急性症狀：卵巢、睪丸畸胎瘤可發生卵巢或睪丸扭轉、壞死，表現為劇烈疼痛和相應的區域性症狀；畸胎瘤當發生繼發感染和囊內出血時，常可腫塊迅速增大，區域性明顯壓痛，並同時伴有發熱、貧血、休克等全身感染或失血癥狀；腹膜後、卵巢、盆腔、骶尾部等部位腫瘤也可突然破裂而發生大出血、血腹、休克等凶險表現。
④腫瘤惡變的症狀：惡性畸胎瘤和良性畸胎瘤惡變時，常表現為腫瘤迅速生長，失去原有彈性、外生性腫瘤可見淺表靜脈怒張、充血、區域性面板被浸潤並伴有面板溫度增高。可經淋巴和血行轉移而有淋巴節腫大和肺、骨轉移症狀，同時出現消瘦、貧血、瘤性發熱等全身症狀。
