多數病人、病人親友及部分醫務人員在對待該病的治療中，更多想到或期望的是有更好的藥物（實際上目前用於腦栓塞治療藥物的作用是十分有限的）使病人早日康復，而忽視了其他治療方面，如：病人的飲食，由於相當數量的腦栓塞病人出現生活不能自理，甚至飲食不能（因吞嚥困難），若不給予鼻飼（經鼻插一管到胃，經此管將食物直接注入胃內），病人的營養、身體內新陳代謝都會很快出現新的問題，如此，即使對腦栓塞本身的治療用藥再好，也難以收到好的治療效果。
因此，應當把病人的生活護理、飲食、其他合併症的處理擺在首要的位置。腦栓塞本身的治療原則是要改善腦迴圈、防止再栓塞、消除腦水腫、保護腦功能。抗凝、溶栓等治療多僅在發病的早期有作用，因此更強調早期治療。皮下注射低分子肝素（副作用較小）等抗凝劑對早期的腦栓塞具有一定治療作用，因抗凝劑（尤其是肝素）引起出血的副作用，應用時應排除腦出血，並注意對患者血凝狀態進行監測。溶栓類藥物（如尿激酶、鏈激酶等）亦可能僅在早期發揮作用。用血管擴張劑及降血壓的藥物時，一定注意病人的血壓，此類藥物所致的血壓過低將會導致腦缺血的進一步加重，應十分注意。
低分子右旋糖酐可幫助降低血粘度、甘露醇等高滲脫水劑可緩解腦水腫，但應用時要注意病人的心臟功能、腎功能情況，以免顧此失彼。對於已明確診斷為風溼性心瓣膜病、人工換瓣術後、冠心病伴心房纖顫、頸動脈等大動脈粥樣硬化等疾病者，應選擇性給予華法令、阿司匹林、潘生丁、苯磺唑酮、藻酸雙酯鈉、塞氯匹啶（ticlopidine）活血素等藥物長期服用可較有效地預防腦栓塞的發生和再發。有條件的心臟瓣膜病患者應儘早合適的心臟手術;初發心房纖顫患者應予及時治療;外傷骨折病人的搬運轉送應符合急救轉送要求。病情穩定後，在醫生的指導下儘早適度進行癱瘓肢體等神經功能缺損的康復鍛鍊，樹立恢復生活自理的信心，配合醫療和康復工作，爭取早日恢復，由於神經功能損害後的恢復有其自然規律，肌肉力量、感覺、語言等功能障礙的恢復快慢依腦損害的嚴重程度不同而異，大多數在病後兩週至半年內逐漸恢復，病人、家屬必須t解這些知識，從而樹立起戰勝疾病、恢復自我的耐心、信心和毅力。社會及家庭給予患者精神及生活的支援，更有利於患者的恢復及生活質量的提高。
