慢性前列腺炎一般為局灶性或節段部分性，前列腺液檢查不能充分反映前列腺炎的嚴重程度，因而不能作為手術依據。對於有精神症狀的慢性前列腺炎患者，更應視為手術禁忌證。
外科手術治療方法包括對前列腺膿腫的引流、切除膀胱頸部、前列腺完全或部分切除、前列腺精囊全切除術、前列腺及其結石的摘除、精囊切除術、經尿道逆行氣球擴張術等。
對於包皮過長或包莖患者，可以在前列腺炎治癒後施行包皮環切術，以減少包皮龜頭記憶體在的大量微生物對前列腺的可能感染機會。
有學者認為包皮環切術應該在治療前列腺炎之前進行，並已經在實踐中獲得了良好的效果。
一些患者在手術切除具有炎症的前列腺後，例如經尿道電切前列腺切除術後，前列腺周圍仍然有含有大量感染灶和結石。
由於病原體可能仍然在前列腺區域存在或由於手術導致擴散，使手術切除前列腺後也不能完全消除患者的症狀，患者仍然可有尿頻、尿急、尿痛、夜尿、會陰部不適或疼痛，甚至出現畏寒、發熱等慢性前列腺炎或急性前列腺炎樣的症狀，所以手術治療有時也很難達到完全徹底治癒的目的。顯然，手術適應證的選擇就要更加慎重。
