隱睪只有通過手術才能治療。隱睪中 2/3 是單側（右側佔70%，左側30%），1/3 是雙側者。按位置腹內者佔8%，腹股溝管內佔72%，而陰囊上側佔20%。睪丸不發育或無睪佔2.6%。
隱睪手術時應注意睪丸位置及形態，充分自腹膜後遊離精索及輸精管以便把睪丸放入陰囊內而無張力，如有張力則需將睪丸固定於陰囊。
隱睪常用的手術方法有：
1.睪丸切除術：高位隱睪已呈萎縮狀態，或成人隱睪，應儘早做隱睪切除，以防發生癌變。
2.睪丸自體移植：因精索太短，睪丸位置太高，鬆解後仍不能牽入陰囊內進行固定，則可將隱睪連同血管一同取下來，移植到陰囊內，在手術顯微鏡下將睪丸血管與陰囊附近的血管吻合，以維持睪丸的血液迴圈。
3.睪丸固定術：適用於2～5週歲，激素治療無效者和單側隱睪。單側隱睪多是由於精索、血管、輸精管短或粘連等機械性因素所造成的，故必須手術治療。手術方法是鬆解睪丸及精索周圍組織，將睪丸牽拉入陰囊內，加以固定。
手術的目的，不僅在於恢復正常的睪丸位置，更重要的是恢復睪丸的正常組織和生精功能。如能在2～5歲手術，則約80%的病例保有生育能力。
因此，應該儘早治療。若是等到成年了，隱睪就有癌變的可能，此時只能放棄生育能力，進行切除手術。
