無論用干擾素或核苷類藥（賀普丁、賀維力、博路定和替比夫定），無論治療有效或無效，都必須定期複查。
抗病毒治療後定期複查的目的，對有效的病人爲了觀察治療後療效是否穩定;對無效病人爲了監控病變的進展。複查的頻度和項目須根據病人的病毒水平、病變程度和治療情況。
◆干擾素治療後的病人
干擾素治療有效的病例少數可能復發。治療只有部分效應的病人，可發生炎症加重，但也可以出現後續效應而病情恢復。
“大三陽”的病人獲得綜合效應（e抗原轉陰、HBV DNA檢不出、肝功能正常）而停藥後1年內須每3個月複查一次，1年後每6個月複查一次谷丙酶。
“小三陽”的病人感染的是變異的乙肝病毒，常會復發。停藥時HBV DNA已不能檢出者， 須每3個月複查一次谷丙轉氨酶和HBV DNA。
治療無效的病人應每1~2個月檢查一次谷丙轉氨酶、必要時檢查病毒定量，考慮再次治療。
所有有效的病人須每年檢查表面抗原半定量，以追蹤表面抗原何時消失而獲得痊癒。
◆核苷類藥治療後的病人
核苷類藥治療有較好的初期效應，長期維持治療（只要不發生耐藥變異）可以有維持效應。核苷類藥停藥後多數會復發，長期進行定期複查非常必要。
停藥後大多數只是復發;其中有的病人會復發加重，尤其在肝硬化病人，可能發生災難性的後果。復發加重的發生率各種藥物不同：賀普丁和博路定約有10%;賀維力可達30%，停藥的病人必需警惕！
停藥時e抗原仍陽性的病人，可能很快病情再活動，需要每個月檢查谷丙轉氨酶。
停藥時如e抗原已經轉陰，而e抗體尚未轉陽者，常在半年內復發。半年內需要每個月檢查谷丙轉氨酶，以後可減少檢查次數。
停藥時e抗原消失並出現e抗體者（即轉爲“小三陽”），如當即停藥，多數也在半年內復發。如繼續治療2年後停藥，停藥1年內約有30%復發;其餘可能在5年內陸續復發;較少數的病人可以穩定不復發，個別病人甚至s抗原（HBsAg）消失而痊癒。
因而，停藥後都需要定期複查，主要是檢查血清轉氨酶，初期每個月1次;然後按情況延長間隔期，但仍需長期複查。
