菲警方表示，在部分遇害人質的初步驗屍報告中發現，全部都是被大火力槍械擊中死亡。菲律賓當局已找到槍手門多薩所用的M16步槍及約60個彈殼。
29日，菲律賓警方表示，他們可以“確定”在上週香港旅行團在菲人質劫持事件中，8名遇害者都是死於劫持者門多薩的槍下。
據報道，29日，菲律賓國家警察（PNP）發言人克魯茲表示，經子彈彈道測試，這8名遇難港人的傷口均是遭劫持巴士內一把大口徑武器造成的。
克魯茲對電臺表示，“相當程度上，我們可以肯定地說，受害者是被門多薩射殺的”。他同時說，“驗屍結果顯示，擊中受害者的所有子彈都來自高火力武器”。
克魯茲表示，劫匪門多薩雖然是一名曾獲傑出警察稱號的前警官，但其在20世紀90年代曾以搶劫和勒索被提出控告。但是，指控因受害者未能出庭作證而被撤銷。而且，經菲律賓警方進一步調查，門多薩因今年早些時候勒索他人財物遭解職，他還被指犯下其他罪行。
8月23日，遭革職的門多薩持M-16步槍在菲首都馬尼拉一處旅遊景點劫持了來自香港的20多名遊客所搭乘的巴士。菲警方隨即與門多薩舉行談判，要求其釋放人質，門多薩先後釋放了9名人質。但是車上仍有10多人處於危險境地。談判在當地時間23日晚7點多破裂，門多薩聲稱自己射殺了2名人質，菲警方隨即對巴士發起強攻。事件最終導致8名香港遊客遇難，7人受傷，門多薩本人遭擊斃。#p#副標題#e#
菲律賓警方因處理此次人質危機不力，被指拖延時機、缺乏組織、裝備和行動力，遭到廣泛批評。
香港8萬人遊行
要求徹查真相
香港特區立法會各政團29日下午聯合發起“沉痛哀悼遇害同胞 要求徹查事件真相”遊行。主辦方表示，參加遊行者達8萬人。遊行在平和的氣氛下舉行。
菲律賓驗屍報告
顯示死者中槍位置
謝廷駿 （31歲） 頭部中1槍
樑錦榮 （58歲） 頸與右臂各中1槍
樑頌儀 （14歲） 左胸和腋下各中1槍
樑頌詩 （21歲） 後腦中1槍
楊綺華 （44歲） 左肩膀中1槍
楊綺琴 （46歲） 頭部中1槍
汪子林 （51歲） 左背中1槍
傅卓仁 （39歲） 左邊身軀中2槍
菲律賓總統下令
三週內提交調查報告
綜合香港媒體報道，菲律賓總統阿基諾三世下令，政府跨部門小組“事故檢討委員會”（IRC）須於三個星期內提交人質事件調查報告。
原建議的5名小組成員之中，除保留司法部長和內政部長外，阿基諾拒絕讓國家警察總長貝爾索薩、國家調查局（NBI）局長和國警內部審計部主管擔任小組成員，改由3名來自私人組織的代表取代，包括當地知名“反罪惡鬥士”洪玉華。
香港特區署理警務處長曾偉雄表示，7名香港警務人員已在菲律賓馬尼拉參與調查工作，包括已登上肇事旅遊巴士蒐證、約見相關證人以及作彈道檢證等。
不過，菲律賓傳媒報道，當地警方禁止香港法證人員登上旅遊巴士調查，只容許他們在外觀察。菲媒引述領導調查工作的菲律賓警長的話指，要待菲當局完成調查，纔可讓香港警方調查，又指他們必須得到菲司法部和警方批准，纔可登上旅遊巴士。
港府保安局強調，香港警方已經獲得菲律賓警方書面授權，保證提供協助，而中國大使館正協助，以取得菲政府合作。
涉案巴士司機神祕失蹤
在劫持事件中，重要證人之一的巴士司機阿爾伯託·盧邦突然失蹤，當地警方正全力追查其下落。當地警方強調，目前仍相信盧邦並非共犯，沒有通緝他，只要求協助調查，不知他何以躲起來。
26日，有記者到馬尼拉警察總部向兇殺組主管阿爾莫多·莫卡雷斯瞭解案件詳情時，他透露了盧邦失蹤的消息，警方欲找他繼續協助調查，但按地址到其住所找尋未果，家人也表示不知其去向。莫卡雷斯說，暫未能確定盧邦失蹤的原因，估計可能因連日來國內外媒體廣泛報道，加上被指是槍手門多薩的幫兇，令盧邦抵受不住壓力而暫時出走。
