侯孝賢早在讀大學時就看過唐傳奇《聶隱娘》，礙於資金技術問題，直到2012年9月纔開拍，全劇耗資約4億5千萬元。侯導曾表示，一半資金來自大陸、另一半是從臺灣、南韓、歐洲等地籌資。爲展現大唐時期的俠義武俠景色，在大陸至少拍了一個月，武當山開鏡、轉往神農架、又轉場內蒙古，最後神農架的畫面全剪掉。內景則是在宜蘭搭設一座壯觀的“聶府”。侯導一貫喜愛長鏡頭和空鏡頭來呈現，背景因此相當重要；編劇之一的謝海盟曾透露，在京都拍攝時，美術組曾出錯，讓侯孝賢氣得猛抓頭，甚至說：“當初阿城說要拍現代版聶隱娘，你們怎麼不說服我？要是拍了，也沒現在這些麻煩！”但也因侯孝賢的堅持，《聶隱娘》有別於一般武俠電影，畫面精緻華美深受外媒稱讚，且侯孝賢認爲隱娘是最高級的刺客，不與人纏鬥，要等到最精準的那一刻出手殺人，纔將“殺人成本”降到最低。女主角舒淇拍得叫苦不迭，男主角張震過足戲癮，大而飾演刺客精精兒的周韻，很能適應侯導的風格。
在戲中，周韻一人分飾兩角，一個是張震的正室，另一個則是戴面具的殺手精精兒。談及這兩個角色，周韻表示這兩個人本身就是一個人，設置兩個角色是爲了表現一個人的兩面性，“其實這個女人要去殺聶隱娘就是因爲她覺得聶隱娘要殺張震演的角色，她其實是維護國家跟保護這個小家。”舒淇曾表示這次與侯孝賢導演合作難度特別大，情緒很難把握，不過周韻卻表示她十分認同導演的這種處理方式，“我拍這個戲是我拍過最輕鬆的一個戲，我覺得我跟侯孝賢對於這種表演方式認同是特別一致的，因爲我希望的就是特別自然的方式。
他其實喜歡演員在演戲的狀態裏面是非常自然的，所以他也會在臺詞方面會要求我，不要說得陰陽頓挫，要收斂一些，不要我在演戲的狀態裏面。”侯孝賢導演對於拍攝是精益求精的，周韻透露：“我進組的時候，練了一些時間（武打招式），第一部分打戲其實是在神農架拍攝的，後來那部分的戲作廢了，導演都沒有要，他覺得我跟舒淇兩個人表情太多了，因爲我戴一面具，只要一砍，臉上的表情就特別的厲害，包括舒淇也是，後來他就宣佈第二年夏天重新拍。”
