第六季主要講述了瑞克一夥人在亞歷山大社區的生存狀況，以及遇到大反派尼根並陷入了前所未有的困境。
瑞克（安德魯·林肯飾）是亞特蘭大城郊一座小鎮的副警長。在執行公務的過程中，瑞克遭到槍擊，傷勢嚴重，被人緊急送往當地醫院進行搶救。當瑞克醒來之後，發現醫院裏已經空無一人。他意識到外面一定出了大事，但又不清楚到底是什麼事。當第六季開始時，瑞克接受了自己的"領袖"地位，現在他自己和其他人也都這麼看待他。他並不想要這種地位，但是他也不會拒絕。他已經完全認可了現實的殘酷，他必須以殘酷來對待殘酷，即便犯下罪惡。只有這樣，他才能當一個父親、一個朋友，才能帶領大家一直抗爭下去。
行屍大軍危及社區許多事情，只有親自去探索，纔會發現更多意想不到的真相。瑞克一行人離開社區，發現數不勝數的行屍被困在一處山窩中。放眼看去，行屍密密麻麻如同一片海洋，大部份集中在山窩裏面，少部份順着山窩往上走動，在半山坡被幾輛廂式貨車擋住。整個山坡如同一個大鍋，行屍大軍想離開山坡，除非突破半山坡的貨車，否則將會一直被困在山窩中。
數以萬計的行屍發出咆哮聲，響徹雲霄氣吞山河，瑞克一行人居高臨下立於坡上，計劃消滅所有行屍。社區原本祥和的局面被皮特打破，皮特殺害了迪安娜的丈夫雷吉，瑞克徵得迪安娜許可擊斃了皮特。
塔拉曾在一次執行任務中身受重傷，膽小怕事的尤金髮揮出驚人的潛能，隻身一人將昏迷不醒的塔拉救出重圍。經過數日休養，塔拉甦醒過來恢復健康，與尤金相視而笑，尤金已經成爲塔拉的救命恩人，兩人之間的距離更近一步。瑞克向所有社區成員講述當下面臨的風險，距離社區不遠的山窩中有數以千計的行屍，一旦阻攔行屍的廂式貨車翻倒，行屍大軍便會如同決堤的洪水涌向社區。
卡特認爲瑞克在威言聳聽，自從目睹瑞克槍殺皮特，卡特對瑞克充滿敵意，對於瑞克提出的誘殺大量行屍方案，卡特持反對意見，他認爲待在社區裏面不去招惹行屍纔是明智之舉。卡特與幾個同伴商量除掉瑞克奪回大權，尤金湊巧在隔牆偷聽，因心中緊張造出聲響被卡特發現，眼看尤金命將不保，瑞克及時出現制服了卡特，做事一向果敢絕決的他沒有立即開槍，在達里爾的提醒下放過卡特。
瑞克雖然饒過卡特一命，死神卻降臨到了卡特身上。他在跟隨衆人執行任務的過程中被行屍咬傷臉部，已經迴天無力，死在瑞克的手上。瑞克自認殺害卡特無可厚非，叮囑本想隱瞞此事的摩根返回社區，將事發經過告訴給所有成員。大量行屍順着公路向前緩慢行走，社區方向忽然傳來刺耳的喇叭聲，行屍大軍被喇叭聲吸引，轉移路線橫穿樹林，潮水一般往社區方向走去。
