1.目前肝切除手術是肝癌首選的治療方法，通過完整的清除腫瘤組織，達到治癒的目的。能否切除和切除的療效除了與腫瘤大小和數目有關，還與肝臟功能、肝硬化程度、腫瘤部位、腫瘤界限、有無完整包膜及靜脈癌栓等有非常密切的關係。行手術切除的患者一般要求其一般情況良好，即沒有心臟、肺臟、腎臟等重要臟器的器質性病變，肝功能正常或接近正常，具體需要客觀的肝功能儲備評估指標，如黃疸水平、白蛋白水平、吲哚氰綠滯留率等指標，同時沒有肝外腫瘤轉移竈，腫瘤部位侷限，而不是多發或瀰漫性分佈。部分肝癌患者術前經影像學檢查或手術探查證實無法手術切除，常見的原因是腫瘤巨大已侵犯周圍血管或切除後殘餘肝臟體積小難以使肝功能代償。對於此類肝癌可以先行放化療使腫瘤體積縮小後再爭取手術機會。
除了肝切除術外還可以選擇肝移植術，尤其對於那些合併肝硬化，肝功能失代償的小肝癌患者，肝移植手術是最佳的選擇。
2.除了手術以外，其他的一些治療方法包括射頻消融、微波消融、高強度聚焦超聲、動脈化療栓塞、酒精注射、冷凍治療、放療、分子靶向治療、免疫治療和中醫藥治療等，主要用於由於各種原因不能接受手術治療的患者。
其中，肝癌射頻消融或微波消融治療原理是利用微波或射頻的熱效應，通過組織中極性分子尤其是水分子的振盪加熱肝組織，從而在靶區內引起熱凝固，通俗點說就是燒死腫瘤，能達到與肝癌切除、肝移植相媲美的根治效果。適用於較小的單發肝癌，並遠離重要血管，肝癌手術切除術後復發或肝功能儲備功能差不能耐受手術切除的肝癌患者。
肝動脈介入栓塞化療即通過動脈置管的方法到達肝動脈，注入栓塞劑或抗癌藥，常用於不能手術切除的中晚期肝癌患者，能夠達到控制疾病延長生存的目的。對於不宜作肝動脈介入治療者和某些姑息性手術後患者，可採用聯合或序貫化療，但是肝癌對化療效果不佳，常達不到好的治療效果。
最近幾年問世的新的分子靶向藥物索拉非尼可以延緩腫瘤進展，能一定程度上延長生存期，此次通過國內外的臨牀試驗結果表明，索拉菲尼可以延長患者生存時間達2-3個月，延緩疾病發展時間爲73%，但該藥物價格較爲昂貴，同時可能會伴有腹瀉、皮疹、高血壓、手足綜合徵等較嚴重不良反應，效果還需進一步評價。
