肛瘻又稱“肛門直腸瘻”，大部分肛瘻由肛門直腸膿腫破潰或切開排膿後形成。膿腫逐漸縮小，但腸內容物仍不斷進入膿腔，在癒合縮小的過程中，常形成迂曲的腔道，引流不暢不易癒合，日久後腔道周圍有許多疤痕組織，形成慢性感染性管道。
按瘻管與括約肌的關係分類：
（1）肛管括約肌間型：約佔肛瘻的70％，多因肛管周圍膿腫引起。瘻管位於內外括約肌之間，內口在齒狀線附近，外口大多在肛緣附近，爲低位肛瘻。
（2）經肛管括約肌型：約佔25％，多因坐骨肛管間隙膿腫引起，可爲低位或高位肛瘻。瘻管穿過外括約肌、坐骨直腸間隙，開口於肛周皮膚上。
①肛管括約肌上型：爲高位肛痿，較爲少見，約佔4％。
②肛管括約肌外型：最少見。僅佔1％。這類肛瘻常因外傷、腸道惡性腫瘤、Crohn病引起。治療較爲困難。
⑨其他：如直腸尿道瘻、直腸膀胱瘻、直腸陰道瘻等，較易與肛瘻鑑別。
