女性非淋菌性尿道炎常用藥物包括米諾環素、阿奇黴素、多西環素、紅黴素、氧氟沙星等。注意妊娠期婦女禁用多西環素、依託紅黴素及氧氟沙星類藥物。
非淋菌性尿道炎主要由於沙眼衣原體和解脲支原體的病菌感染才引發的，但是同時也是性病傳染疾病，可以通過不潔的性生活傳染給別人，女性朋友也是高發人羣。
非淋菌性尿道炎的致病微生物，對藥物會產生一定的耐藥性，病原微生物在發病的時候，遇到免疫系統的吞噬和藥物的殺滅時，能夠釋放假性的靶目標，直接影響到病毒殺滅的效果，傳統藥物對殺滅微生物具有一定的限制，比較難以清除，所以在選擇藥物的時候不能盲目，在用藥時一定要聽從醫生的指導意見，安全合理用藥，防止用藥不當引起嚴重不良反應。
