所有的手術都伴有感染和血栓形成的危險，肥胖者更容易併發不良反應，尤其是有早期糖尿病和心臟病症狀的患者。美國2004年的政府報告估計減肥手術的死亡率大約爲0.19%。年齡大，高血壓的肥胖者死亡率會更高一些，但是減肥手術成功後會使嚴重肥胖患者患心臟疾病患病率降低50%，而且研究還顯示：實施手術者比條件相同單位實行手術者存活時間更長。因此，雖然手術有風險，但它也挽救生命。
出於最大限度降低手術風向的考慮，醫生會要求患者做詳盡的術前準備以期術前發現患者存在的問題。患者通常還會發現，這些例行的檢查還能幫助自己同時做好精神上的準備。它們能幫助患者更清楚地認識到自己的想法，同時讓患者做好另外一種進食方法的準備。
手術期待減肥手術和其他手術一樣，需要術後恢復期。術後恢復的時間因人而異，但至少需要一個星期，通常是3-4個星期。
新的手術技術使術後恢復時間減少。當今的減肥手術都是微創的。在美國一些先進的醫療中心，減肥手術甚至可以在門診完成。
大多數肥胖者術後一個月之內每天會減少大約一磅的體重，一年之後會減少多餘體重的50%-75%。但即使到這個時候，這個過程並沒於停止。患者會因爲營養不良出現相關部兩反應，比如貧血，骨質疏鬆，代謝性骨病等等。因此，手術後要有健康的飲食，運動能夠，規律的隨診以監視營養狀況。
問自己的問題如果你正在考慮手術減肥，請捫心自問一下的一些問題（來自美國糖尿病，消化和腎臟疾病協會），如果你所有的回答都是肯定的，那麼立即聯繫初診醫生和保險公司。
（1）是否所與非手術方法都不能使體重減輕？
（2）是否認真瞭解手術過程和治療效果？
（3）手術是否是爲了改善身體健看？
（4）是否瞭解術後生活會發生怎樣攻的改變（比如必須很慢的咀嚼食物，必須少量進食）？
（5）是否瞭解手術的嚴重併發症，飲食限制和可能存在的手術失敗？
（6）能否堅持終身隨訪和補充維生素及礦物質
