光緒六年(1880年)時，慈禧太后得了一場大病，久拖不愈，當時宮中御醫都束手無策，於是朝廷便以光緒皇帝的名義發了一道上諭，讓各地火速推薦醫術高明的醫生前來京城爲慈禧太后看病，越快越好。慈禧這次生病的原因，主要還是多年的積勞成疾，加之正處於更年期(是年46歲)與伊犁危機，由此一病不起。由於病情危重，慈禧太后這次治病和調理的時間就比較長，正當大臣們爲之感到擔憂時，宮中突然傳來消息太后崩逝了!
令人吃驚的是，當人們都以爲去世的是慈禧太后時，事實上卻是另一位慈安太后。《清稗類鈔》中即有這樣一段記載，時任軍機大臣的左宗棠在聽說慈安太后突然暴病身亡後，其頓足大聲說：“昨早對時，上邊(慈安)清朗周密，何嘗似有病者?即去暴疾，亦何至若是之速耶?”另一段記載則說，御醫薛福辰在慈安太后去世當天的早晨曾爲之請脈，其認爲不須服藥;是日午後，薛往謁戶部尚書閻敬銘，閻留與談;傍晚時，一戶部司員持稿詣請畫諾，畫稿畢，該司員說：“出城時，城中宣傳東後上賓，已傳吉祥板(棺木)矣。”薛福辰聽後大驚失色，道：“今晨尚請脈，不過小感風寒，肺氣略不舒暢耳，何至是?或西邊(指西太后)病有反覆，外間訛傳，以東西互易耶?”
以上兩則記載頗有玄機。據宮中的記載，慈安太后突然去世的前一天，她的確照常召見了大臣，當天除了“兩頰微赤”外，並無其他異常。次日(光緒七年三月初十)，慈安太后感到身體不適，當天就安排休息而沒有辦公，不料到晚上便突然去世了，年僅45歲。
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慈安太后的突然崩逝，不但讓人感到意外，也讓人疑竇叢生。事實上，在人們印象中，慈安太后一向康健，這次病情何以會如此之重、去世又如此之快呢?對此，民間議論紛紛，由此也演化成諸多的稗官野史。
《清代野記》中說，咸豐在熱河臨危之際，曾經密授一紙硃諭給慈安太后，說如果某人恃子爲帝、驕縱不法的話，你到時即可按祖宗家法懲治。咸豐駕崩後，慈禧太后果然熱衷於擅權，甚至宮闈之中也傳出了荒淫醜聞。某年，慈禧太后忽然患重病，幾至不治。後來有人說是血崩，說是李蓮英經常帶一個宮外的小夥子史某進宮遊玩，小夥子長得身材苗條，面容俊美，有一次被慈禧太后看見，問其是誰，李蓮英只好據實回奏。慈禧太后並沒有怪罪，反怒爲喜，轉而將之藏在宮中，晝夜宣淫，不久便有血崩之疾，史某也被殺人滅口;也有說後來生下了光緒，隨之送往自己妹妹家(醇親王府)收養，這也就是慈禧太后不爲同治立嗣的原因所在。
也許是慈禧鬧得太不像話了，某日，慈安太后在宮中設酒和慈禧太后共飲。酒至中巡，慈安屏退左右，和慈禧說起當年熱河咸豐死後，肅順專權及其政變後勵精圖治的事情，慈禧也頗爲感傷唏噓。隨後，慈安話鋒一轉，說：“我們老姊妹現在年紀都大了，我們兩人相處了二十多年，彼此同心。今有一物，乃是當年先帝所賜，有必要拿給你看一下。”
隨即，慈安太后便從袖中拿出一函，正是當年咸豐留下的遺詔。慈禧太后一見，嚇得臉色發白，慌忙拜倒在慈安太后腳下，自稱有罪，涕淚橫流，苦苦哀求。自此，慈禧服侍慈安太后幾乎無微不至，絲毫不敢有所得罪。數年過後，慈安太后以爲慈禧已無他心，便也逐漸放鬆了對慈禧的戒備。
有一次，慈安太后生了小病，一天正好慈禧來看望，慈安見慈禧左臂纏了一塊白布，以爲她受傷了，便問怎麼回事兒。慈禧說：“前日參汁中，曾割臂肉一片同煎，聊表我的心意。”慈安太后大驚，感極而泣說：“我真沒有想到你是如此的好人，先帝怎麼會懷疑你呢?”隨之，慈安太后便取出密諭，當着慈禧的面把它燒了。
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慈禧心頭竊喜，後來便開始逐漸放肆。某日，慈安太后到慈禧住處，兩人談了一會兒話後，宮女送上一盒月餅，慈安嚐了一個後覺得味道很好，說這似乎不是御膳房裏做的吧?慈禧說不是，這是自己妹妹家做的，姐姐要是喜歡的話，明天再給你送過去。慈安太后說太麻煩了，就算了吧。慈禧說，我們姐妹何必見外，我妹妹家就是你妹妹家。
過了幾天，慈安太后果然收到了慈禧送來的月餅，樣式和味道和上次吃到的沒什麼兩樣。不料，當天晚上慈安太后便覺得腹痛難忍，御醫來後也束手無策。
沒過多久，慈安太后便含恨去世，估計就是慈禧在月餅中下了毒。
慈安太后被慈禧用毒餅害死及咸豐密詔事均來源於惲毓鼎的《崇陵傳信錄》，惲毓鼎曾擔任過光緒皇帝的日講起居注官。此後，這兩種說法又被各種野史加以誇大演繹，不過這些故事情節固然生動有趣，但終究禁不起推敲。如熟稔清宮掌故的著名學者金樑即對此提出質疑：“近人依託宮闈，流言無實，尤莫甚於惲氏筆錄所載孝貞暴崩事。即雲顯廟手敕焚燬，敕語何從而知?食盒外進，又誰確見?惲氏曾事東朝，橫造影響無稽之言，後之覽者，宜深闢之。”
事實上，慈安和慈禧這兩宮太后的關係一向比較融洽，並不存在什麼尖銳的矛盾。慈安雖貴爲中宮之首，但她本人識字不多，又爲人和善，對政治也沒有興趣。如曾出使歐洲的薛福成即記載說，“東宮見大臣，吶吶如無語者。每有奏牘，必西宮爲誦而講之，或竟月不決一事。”所幸的是，慈禧則對政治頗有天賦，正好彌補了慈安的缺陷。在兩宮太后的垂簾聽政安排中，慈安德高望重，慈禧才幹突出，可謂相得益彰。在近三十年的時間裏，宮中的兩個重要女人一直保持了相對和諧與穩定的關係，這在以往的後宮歷史中都是不多見的。
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當然，慈禧與慈安也不是完全沒有矛盾，如前面提到的安德海被殺和同治選皇后之事。安德海是慈禧太后寵信的太監，他在出京南下途中被山東巡撫丁寶楨殺掉，這得到了慈安太后和恭親王奕的支持;另外，同治選皇后時，他違背了慈禧太后的意旨而選擇了慈安太后看中的阿魯特氏，這讓慈禧感到十分鬱悶，她無法理解和原諒的是，自己的親生兒子竟然會將慈安太后置於比自己更高的地位。
但是，這兩件事尚不足以證明慈禧對慈安懷恨在心，因爲殺安德海的丁寶楨後來非但沒有被慈禧太后非難，反而一升再升，死後還獲得了“文誠”的諡號;而對於同治和皇后的不滿，隨着這兩人的先後離世，慈禧也似無必要記恨於慈安太后。
由此看來，說慈禧謀害了慈安顯然只是民間傳聞，並沒有確鑿的證據支持。事實的真相很可能是，慈安太后的確是突然發病而亡。當時，光緒的師傅翁同兼任禮部尚書，由於其負責辦理了慈安太后的喪儀，因此得以瞭解慈安太后的整個發病過程和死因。
