1991年11月26日，傑克遜發行了個人第八張專輯《Dangerous》，首支單曲《Black or White》的音樂錄影帶發行後也成爲繼《Billie Jean》之後的傑克遜最受歡迎的單曲。傑克遜開始嘗試New Jack Swing音樂，專輯的前半部是專爲New Jack Swing音樂而創造的，收錄的歌曲有《Jam》、《Remember The Time》，以及反映種族問題硬搖滾單曲《Black or White》。1993年，邁克爾先後獲得美國音樂大獎“國際藝人大獎”、“格萊美傳奇獎”、“年度人道主義獎”以及世界音樂大獎所頒發的三個獎項。1995年，邁克爾與索尼合併的出版部門創造索尼音樂出版他的ATV音樂目錄。邁克爾保留一半的公司所有權。同年6月16日，他發行了雙碟專輯《History》。邁克爾在《History》專輯中進行了鍵盤，合成器，鼓，打擊樂器，吉他的演奏。《History》中的單曲《Scream》是對媒體的歌曲鬥爭。MV由邁克爾和妹妹珍妮·傑克遜完成，獲得了1996年的格萊美最佳音樂短片獎。
R&B曲風的《You Are Not Alone》是其中的第二支單曲。之後，《History》獲得了格萊美最佳專輯的提名。2001年10月30日，專輯《萬夫莫敵》發行。這是邁克爾·傑克遜生前最後一張創作專輯。首支單曲《You Rock My World》是一首帶有濃重絃樂編曲烘托的作品，由Rodney Jerkins擔當製作大任。2001年，以獨唱藝人的身份再度入主搖滾名人堂。
邁克爾·傑克遜的藝術性不僅包括音樂，還有舞蹈，是服裝，是化妝設計，是舞臺燈光焰火，是一個完整的娛樂節目。邁克爾·傑克遜不僅限於音樂，他在舞蹈上的創造力亦是優秀。他有“機器人”舞步和著名的“太空步”。他的舞蹈動作（如手摸下體等）也衝擊了社會世俗文化道德標準的界限，被所謂正統人士抨擊爲“下流”。而正是這些大膽的充滿挑戰的舞蹈動作影響了之後幾代的流行樂舞臺。
