先天因素指一生下來就出現的宮頸疾病現象，並不是後天因素所造成。比如宮頸管狹窄和雙宮頸畸形等。
1、先天性宮頸管狹窄：見於母親於妊娠早期服用過己烯雌酚所生女兒，其至青春期出現陰道腺病、宮頸狹窄和糜爛、宮頸上皮間變、腺癌或透明細胞癌，系由於己烯雌酚於妊娠早期干擾正常性組織器官分化所致。
2、宮頸管發育不良：可伴子宮發育不良。嚴重發育不良的宮頸呈細長形。中度發育不良的宮頸長度與宮體之比爲1：1，即所謂“青春型子宮”。宮頸發育不良可導致宮頸腺體分泌功能不足。
3、宮頸缺如和雙宮頸畸形：宮頸缺如爲副中腎管尾端發育停滯所致，可合併陰道上端閉鎖或子宮發育畸形。雙宮頸畸形爲雙側副中腎管中段未融合所致，故常合併雙子宮畸形。
4、宮頸粘液異常：它的物理性質和化學性質的異常，一般與免疫因素、內分泌的不平衡或生殖器官的異常有關，如生殖道脫垂、後轉性或後屈性子宮、宮頸狹窄、宮頸截除、良性腫瘤、先天性異常等。
疾病因素1、宮頸管閉鎖與狹窄
先天性宮頸管閉鎖或狹窄多由於雙側苗勒氏管下段形成和融合不全所致。臨牀上罕見，常伴有子宮發育不全，第二性徵大多發育正常。如患者子宮內膜功能良好時，青春期可因宮腔積血而出現週期性下腹痛，或月經過少伴痛經，經血還可經輸卵管逆流入腹腔，引起盆腔子宮內膜異位症。
後天性宮頸管閉鎖與狹窄多見於人工流產後或宮頸炎電灼、冷凍治療後。主要原因是吸宮時宮頸擴張不充分，或帶着負壓取出吸管，造成宮頸內膜損傷，創面粘連閉鎖。宮頸炎治療電灼或冷凍過深導致宮頸管粘連或狹窄。臨牀表現爲人工流產後或宮頸炎治療後出現閉經伴有周期性下腹痛。婦科檢查發現陰道呈紫藍色，宮頸舉痛明顯，宮體稍飽滿、活動，有壓痛。
2、宮頸管發育不良
可伴子宮發育不良。嚴重發育不良的宮頸呈細長形。中度發育不良的宮頸長度與宮體之比爲1：1，即所謂“青春型子宮”。宮頸發育不良可導致宮頸腺體分泌功能不足。
3、宮頸管位置異常
常伴有子宮體的位置異常。慢性盆腔炎或子宮內膜異位症等可引起子宮極度後傾、後屈或前屈，使宮頸外口貼向前穹窿，致使後穹窿變淺而失去了貯精池的作用，從而不利於精子的上行。此外宮頸延長、過短或宮頸脫垂亦可能改變了宮頸外口與後穹窿之間的正常的位置關係，妨礙精子上行。
4、宮頸肌瘤
宮頸肌瘤造成不孕原因主要是頸管發生變形、狹窄，影響精子通過。臨牀表現主要爲月經不規則，經血量增多，白帶增多或膀胱、直腸症狀。部分患者無症狀。婦科檢查可發現宮頸局部有突出肌瘤結節或子宮頸外形發生改變，肌瘤所在一側宮頸擴大，而對側被壓變薄，宮頸外口伸張展平呈麻花形。
5、慢性宮頸炎
慢性宮頸炎是婦科常見病，一般不影響受孕。正常宮頸粘液能保護精子，供給能量，並且是貯存精子的場所。臨牀表現主要症狀是白帶增多。由於病原菌、炎症的範圍及程度不同，白帶的量、性質、顏色及氣味也不同，可呈乳白色粘液狀，有時呈淡黃色膿性、伴有息肉形成時易有血性白帶或性交時出血。當炎症經子宮骶韌帶擴散至盆腔時，可有要、骶部疼痛、盆腔部下墜痛及痛經等，每於月經、排便或性交時加重。檢查時可見宮頸有不同程度的糜爛、肥大，有時變硬，見息肉、裂傷、外翻及腺體囊腫等病變
6、宮頸粘液異常
宮頸粘液中所含的葡萄糖及其它營養物質對穿越宮頸時的精子的生存和活動力有很大影響。因爲精子本身僅儲存少量糖原，在它停留及穿越女性生殖道時必須依靠細胞外的營養物質來滿足自身能量的需要。卵巢激素調節宮頸粘液的分泌，宮頸粘液的物理特性及某些化學組成呈週期性改變以利於精子的穿透、營養及生存。
7、宮頸糜爛
宮頸糜爛是慢性宮頸炎的局部特徵之一，宮頸糜爛是比較常見的婦科疾病，宮頸糜爛分爲輕、中、重度。凡糜爛面積佔子宮頸總面積1/3者爲輕度宮頸糜爛，面積佔子宮頸爲1/2者爲中度宮頸糜爛，糜爛面積超過子宮頸總面積1/2以上者爲重度宮頸糜爛。
