肝動脈化療栓塞(TACE)主要適用於不能切除的肝癌，特別是以右葉爲主或多發病竈、或術後復發而不能手術切除者。肝癌根治性切除術後採用積極的干預治療預防復發是提高肝癌療效的重要手段。肝癌根治性切除術後TACE可進一步清除肝內可能殘存的肝癌細胞，降低復發高峯期的複發率。但對播散衛星竈和門靜脈癌栓的療效有限，更難控制病竈的遠處轉移，且不能阻斷肝癌的發生。爲了達到長期防治的目的，需與其他治療方法特別是生物治療聯合應用。對於姑息性切除術後殘癌或根治性切除術後復發不能再切除的病例，TACE仍是首選的治療方法之一。
超聲導引下經皮穿刺瘤內注射治療，安全性高、不良反應輕微、可反覆進行，其中無水乙醇注射(PEI)已在臨牀廣泛應用，適用於腫瘤直徑5cm以下、病竈一般不超過3個、腫瘤位於肝門部大血管附近、全身情況較差或切除術後復發不能耐受手術的患者。對於直徑3cm以下的原發性肝癌，因組織成分單一、乙醇彌散完全，其療效接近於手術切除，部分病例可獲根治效果。
大肝癌常有腫瘤包膜浸潤或血管侵犯，宜與其他療法(TACE等)結合應用。乙酸(15%～50%)比無水乙醇具有更強的組織滲透能力，易於穿透癌組織內的纖維間隔而均勻彌散，其注射次數及注射總量均明顯減少。熱鹽水或蒸餾水可注入較大劑量而用於大肝癌的治療。但實際應用時瘤竈內溫度難以控制而直接影響療效，且大量注射產生的高壓有可能引起癌細胞擴散，應予以重視。
經皮穿刺瘤內射頻消融治療(RFA)主要適用於直徑3cm以下、病竈數<4個、無門靜脈癌栓或肝外轉移的肝癌，其腫瘤完全壞死率可達90%以上，接近手術切除療效。通過瘤內注射無水乙醇減少血供及注射高滲或等滲鹽水擴大治療範圍可提高療效，亦可與肝動脈栓塞聯合應用治療大肝癌。
經皮穿刺瘤內微波固化治療對直徑<2cm的肝癌常可達到完全性壞死，但不宜治療靠近膽囊、膈肌或大血管周圍的腫瘤。對直徑>3cm者則可採用多針穿刺、多點組合輻射以提高療效。經皮穿刺瘤內激光熱療目前主要用於治療直徑<2cm的肝癌，還具有止血作用，並能刺激機體的免疫力，促進機體殺滅腫瘤，多光纖多點治療可擴大凝固範圍。激光消融對門靜脈癌栓也有一定的療效。
高強度聚焦超聲(HIFU)治療利用高強度超聲波波長短、易於穿透組織的特點，聚焦於深部肝癌，在短時間內產生高溫直接殺死腫瘤組織。但HIFU聚焦區域小，治療腫瘤需反覆多次進行。由於肋骨和胃腸等空腔臟器對高強度超聲的吸收和反射，使治療入路受到限制。
肝癌的冷凍治療對鄰近大血管損傷較小，且可誘導機體免疫功能，因而簡便安全。近年應用氬氦靶向治療系統(氬氦刀)可在超聲或CT引導下經皮穿刺治療，高壓氬氣快速釋放產生超低溫繼以高壓氦氣產生熱效應，最大限度摧毀腫瘤組織。目前適用於直徑>3cm、無嚴重心肺和肝功能障礙、無出血傾向、無大量胸腹水或廣泛轉移、未累及肝門或下腔靜脈的腫瘤結節。
放射治療對肝癌相對不敏感，但對於全身情況較好、肝功能基本正常的侷限性腫瘤(主要位於右葉)部分病例可獲根治。對腫瘤較大或轉移病竈有一定姑息療效。
肝癌的單個或多種藥物聯合全身化療多無明確療效，可用於肝癌不宜切除和姑息性切除術後。目前多經肝動脈插管局部灌注給藥或與栓塞劑合用於化療栓塞，在腫瘤區域聚集高濃度藥物，可取得一定療效。生物治療通過調節機體自身的生物學反應，提高防禦能力，抑制腫瘤生長，對於防治肝癌根治切除術後的復發及控制轉移可能有較大的價值。目前多采用局部或區域治療，或與其它治療如肝動脈栓塞聯合應用。
中醫中藥主要適用於手術、放射、化學藥物等的輔助治療，應根據肝癌患者的不同情況，採用不同的治則。在中西醫結合治療時應注意整體的攻補兼顧。
