雖然熟地黃是臨牀頗爲常用的一味滋補中藥，但仍有許多禁忌需要注意。
一、炮製煎煮不可見銅鐵器。
《雷公炮製藥性解》雲：“採得生地黃，去白皮，磁鍋上柳木甑蒸之，攤令氣歇，拌酒，再蒸，又出令幹，勿令犯銅鐵，令人腎消，並白髮，男損營，女損衛也。”熟地黃炮製不可見銅鐵，煎煮亦不可用鐵鍋、鐵壺。《藥鑑》：“若犯鐵器，令人腎消。”貯藏應如《本草從新》言，“味甘如飴，須瓷器收之，以其脂柔喜潤也”。
二、服食忌蘿蔔、三白、諸血等。
《本草品彙精要》記載：忌蘿蔔、蔥白、韭白、薤白。《要藥分劑》雲“忌萊菔、蔥、蒜、諸血”。蓋萊菔子降氣，三白辛竄走氣，影響地黃的滋補作用。諸血爲血肉有情之品，恐滋膩太過，故宜禁之。
三、傷寒家不宜用。
傷寒之病，邪從外入，宜疏散而不宜滋補。如《神農本草經百種錄》言：“又仲景《傷寒》一百十三方，惟復脈用地黃。蓋傷寒之病，邪從外入，最忌滋滯。即使用補，必兼疏拓之性者，方可入劑。否則邪氣向裏，必有遺害。今人一見所現之證，稍涉虛象，便以六味湯爲常用之品，殺人如麻，可勝長嘆。”
四、脾虛痰多氣鬱之人慎服。
熟地黃味甘，性尤滋膩，脾虛痰多氣鬱者慎用。《本草從新》雲：“按熟地黃性滯，痰多、氣鬱之人，能窒礙胸膈，用宜斟酌。”《本草徵要》雲：“熟者性滯，若痰多氣鬱之人，能窒礙胸膈，當斟酌用之。”《本草通玄》言“熟地性滯，痰多者，恐其泥膈，宜薑汁炒之，以制其滯。更須佐以砂仁、沉香二味，皆納氣歸腎，又能疏地黃之滯，此用藥之權衡也”。
