男性生殖器官畸形引起的不育：
A、陰莖畸形：無陰莖、無龜頭、陰莖勃起組織發育不全，隱匿性陰莖（多見於肥胖者，陰莖被埋於包皮及恥骨區皮下脂肪組織內）、雙陰莖、小陰莖、蹼狀陰莖、先天性陰莖重度變曲、嚴重的包莖和包皮過長引起萎縮性包莖，包皮緊包陰莖頭並與其黏連在一起，陰莖頭髮育不良，變形並可引起痛性勃起和性交障礙；
陰莖陰囊轉位（陰囊在前、陰莖在後），本畸形十分罕見，但陰囊陰莖部分轉位較常見，即陰莖被陰囊部分包圍或全部包圍。
B、尿道畸形：無尿道或尿道閉鎖、重複尿道（一般是指一個陰莖上有兩條或兩條以上的尿道；雙陰莖時，每個陰莖上有一條尿道，也叫重複尿道。）、尿道上裂、下裂等均可影響性生活和生育。
C、睾丸先天畸形：單純雙側無睾丸罕見，無生育能力。單側無睾丸多合併無附睾而泌尿系統正常；單側無睾丸、附睾、輸精管、腎和輸尿管。這兩種情況可能不影響性功能和生育。隱睾症、睾丸發育不全均可引起不育。
D、附睾畸形：附睾畸形種類較多，有附睾缺如、附睾節段性閉鎖、附睾發育不全、附睾睾丸不連接、附睾囊腫等，約5%的男性不育症可能 與附睾畸形有關。
E、雙側精囊缺如及精囊囊腫。
F、前列腺缺如和前列腺囊腫性不育。
