1、微生物檢查：男性泌尿、生殖系統感染常常導致男性不育，與男性泌尿、生殖系統感染有關的病原微生物有細菌、病毒、螺旋體、支原體、衣原體等，常見有淋球菌、乳頭狀瘤病毒、腺原體、沙眼衣原體等。
2、遺傳學檢查：男性相關染色體及基因的正常是維持正常生殖功能的基礎，染色體及基因的異常對導致性分化異常和精子生成障礙，從而嚴重影響生殖功能，可能會導致男性不育。因此，對現有性別分化異常或身體有其他遺傳缺陷、無精症和嚴重少精症、有遺傳病家族史、習慣性流產夫婦做染色體及基因檢查，有着十分重要意義。
3、內分泌檢查：生殖內分泌功能障礙影響男性的性功能和生殖功能，是男性不育的一個重要原因，內分泌檢查主要是有關性激素T、FSH、LH、PRL、E2的測定和各種激發試驗，如HCG刺激試驗等。
4、精液分析：這是測定男性生育力的最基本、最直觀的臨牀指標，有關精液的參數是醫師最先需要了解的，男性不育患者要注意的是：3-5天不同房去檢查；要能保證獲得全部精液；2周內複查1-2次。
5、精漿生化檢查：對精漿的化學成分分析有助於對附睾、前列腺、精囊腺功能的瞭解。男性不育患者有精液量少、無精症、少精症、不明原因的精子活動力下降、附屬性腺先天缺陷及附屬性腺疾病等情況時，可作精漿生化檢查，常見有果糖、肉毒鹼、酸性磷酸酶等。
6、前列腺液檢查：前列腺炎可導致男性不育。前列腺液檢查可爲前列腺炎的診斷提供重要依據。
專家表示，不孕不育症患者第一次就診時，最好夫妻同時去醫院檢查。通過對雙方的初步檢查(如男性精液檢查，女性婦科檢查或必要的化驗)，如能發現線索，則可根據具體情況把進一步檢查的重點放在丈夫或妻子一方。這樣可以少走許多彎路，有利於儘快明確診斷。
