目前治療乙肝的藥物不外乎以下幾種：保肝藥物、免疫調節藥物及抗病毒藥物。現對其做簡單的介紹。
1、“保肝”藥物
輔助和對症藥物的治療俗稱“保肝”治療。目前輔助藥物衆多，商品名稱更多，按其作用類型可區分爲幾大類。
?具有綜合作用的藥物。包括：護肝藥物有肌苷、益肝靈（水飛薊素）、VitB、VitC等;
?緩解炎症藥物有複方甘草甜素、甘力欣、強力新（強力寧）等;
?降酶藥物有聯苯雙酯、五味子、垂盆草等;
?退黃藥物有門冬氨酸鉀鎂、腺甘蛋氨酸、苯巴比妥等;
?中草藥有山豆根（肝炎靈）、苦蔘素等;抗纖維化藥物有干擾素、秋水仙鹼等。
但是，理論上有某種“護肝”作用的藥物，經吸收代謝後在體內未必有同樣作用;且體內代謝過程極其複雜，加強或者抑制其中一個環節，亦難以預知其最終結果。
2、免疫調節藥物
許多臨牀現象表明：慢性乙肝的發展和後果，主要取決於宿主的免疫應答，故應用一些免疫調節藥物，可能阻止或改變疾病的發展。免疫調節藥物包括
?免疫增強劑如左旋咪唑、胸腺肽α等;
?免疫抑制劑如糖皮質激素、秋水仙鹼等;
?重組細胞因子如白細胞介素-2、白細胞介素-12、粒-巨噬細胞集落刺激因子（GM-CSF）等;
?其他如轉移因子、特異性免疫核糖核酸、乙肝免疫球蛋白等。
免疫調節藥物須在醫生的指導下使用。
3、抗病毒藥物
目前認爲，乙肝病毒的持續感染是造成乙肝慢性化的主要原因，且可導致病情發展、惡化至肝硬化、HBV相關性肝細胞癌。因此，抗病毒治療是慢性乙肝治療的關鍵。
目前尚無一種能迅速、直接清除乙肝病毒的藥物。目前最好的抗病毒藥物的療效也僅能達到50%左右。國內外醫學界所公認的治療慢性乙肝有確切療效的抗病毒藥物主要有兩大類：α干擾素和核苷類似物。α干擾素如賽若金（重組人干擾素α1b）、進口及國產干擾素α2b、α2a、組合干擾素、長效干擾素等。核苷類似物如Lamivudine、泛昔洛韋等。
干擾素作用於細胞上的干擾素受體，誘導和激活細胞抗病毒蛋白基因，產生抗病毒蛋白，起到抑制病毒的作用;它還可以誘導2‘-5’寡腺苷酸合成酶系統的（2‘-5’ OAS）和蛋白激酶，抑制病毒的複製。從以上機制來看，干擾素不能殺滅病毒，只是起抑制病毒複製的作用，一旦撤除干擾素病毒又重新複製。因此干擾素的對於肝炎病毒的治療複發率高，所以要求療程長（4—6個月），如果能聯合使用免疫調節劑，提高患者自身固有的免疫力，可達到相加效應，以企提高干擾素的療效。
拉米夫定爲核苷類似物，有強大抑制HBV複製的作用，吸收進入體內後在肝臟中在逐步加入磷酸形成活性5‘-三磷酸鹽，類似脫氧胞苷三磷酸鹽可以滲入病毒DNA終止DNA的合成：可競爭性的抑制HBV病毒DNA依賴和RNA依賴的DNA多聚酶和逆轉錄酶的活性，從而達到迅速抑制HBV-DNA的複製，明顯降低血清HBV-DNA水平。
作用特點：毒性低，可以長期治療;口服吸收良好，每天服藥一次，使用方便，病人依從性好;短期治療後停藥複發率高;長期治療後，乙肝病毒易發生變異及耐藥。
基因治療是將目的基因重組到載體上進入機體後所表達的產物能治療患者的病，或滅活患者的有害基因。這種通過對基因的修飾、置換或滅活達到治療疾病的目的，稱爲基因治療。目前，人們正在探索基因治乙肝過程中。
中藥在治療乙型肝炎的臨牀應用中證明：護肝、降酶及改善症狀的療效是確切的，但殺滅乙肝病毒而不損傷肝細胞則是還有待解決的難題……
全息自灸療法可提高乙肝患者自身抗病毒能力，臨牀應用也屢獲良效。
