近年西醫採用減少胃酸的西咪替丁或洛賽克及消滅幽門螺旋桿菌的阿莫西林、甲硝唑或克拉黴素來治療胃竇炎，取得一定療效。另外，還常用強化黏膜防禦能力的硫糖鋁或膠體次枸櫞酸鉍。爲減少噁心、嘔吐症狀，一般還會加用嗎丁啉。如果療效欠佳，就需要採用中西醫結合療法。
由於胃竇炎是一種慢性病，所以中藥對防治胃竇炎有較好的療效，常用的有清熱理氣和調理脾胃的藥，如蒲公英、黃芩、白芍、陳皮、烏藥、山藥、香附、延胡索、枳殼、木香、北沙蔘等。中成藥有猴菇菌片、香砂六君子丸、胃復春等。以上藥物可以根據醫囑酌量服用。
需要提醒的是，現在已有準確可靠的方法檢測慢性胃炎的發病原因了，並可以進行鍼對性的治療。所以儘管感覺孩子的症狀是慢性胃炎，也最好不要在家給孩子自行用藥，要及時到醫院檢查治療，以免用藥不當加重病情。
