（一）腺樣體增殖
鼻咽癌的鑑別診斷首先是腺樣體的增值，因爲這種情況常見於幼兒、青少年腺樣體質者。鼻咽頂部。咽扁桃體腫大，粘膜正常、當高度增殖或表面潰爛或有肉芽腫樣形成，注意癌變、應予活檢。
（二）鼻咽部炎症
其次，鼻咽癌的症狀還有及時鼻咽癌的炎症，專家稱常見粘膜粗糙，分泌物多，可見表面高低不平，多數濾泡增殖爲0.2～0.3釐米大小的結節、呈紫紅色，有時橙黃色，常伴鼻腔粘膜炎、喉炎、副鼻竇炎及咽後壁淋巴組織增殖呈小結節狀。可用清熱、利咽、活血化瘀法治療。
（三）鼻咽良性腫瘤
其次，鼻咽癌的症狀還會出現鼻咽良性腫瘤，專家稱因爲這些比較少見、病程較長、好發於項前部，呈圓形隆起或分葉狀，表面光滑。如纖維瘤、纖維血管瘤、混合瘤、脊索瘤等。
（四）頸部淋巴結炎
鼻咽癌的鑑別診斷？急性淋巴結炎若爲一般致病菌引起‘多有紅、腫、熱、痛·局部溫度增高，常伴有口腔、咽腔感染病變、白細胞數增多、中性粒細胞偏高，淋巴結輕度或中度腫大，光滑，質軟活動，觸痛明顯，邊界清楚，抗炎治療有效。慢性非特異性淋巴結炎、無論細菌或病毒引起的頸部淋巴結腫大，局部皮膚色澤正常，體溫不高。觸痛不明顯。常呈黃豆或蠶豆大小。光滑，質韌，活動、邊清、常隨咽腔、口腔、耳部炎症輕重而變化、抗炎治療多不理想。
（五）鼻咽結核
少見，多有鼻咽部不適，異物感。分泌物增多，常伴發其它器官結核，如肺結核等。
（六）惡性淋巴瘤
發病較急，病程較短，多發於青少年，病變可累及整個鼻咽腔，常見雙側或他處淋巴結普遍腫大，質地較轉移性淋巴結軟，有彈性感，臨牀上常需作病理檢查進行鑑別診斷。
