成人沙眼衣原體和支原體的感染，主要是通過性傳播。而兒童的感染主要是通過間接接觸引起，特別是幼女由於其母親或保姆感染本病，通過間接接觸引起感染。如母親感染支原體可以通過生殖道在分娩時引起新生兒感染。在胎膜完整的情況下，從羊水、胎盤和胎兒血液中可分離出支原體，因而證明胎兒在宮內也可發生感染。
沙眼衣原體與淋病的關係。
1、淋病患者的沙眼衣原體的分離率也明顯高於不合並淋病的人羣。
2、沙眼衣原體與淋病有非常密切的關係，淋病對衣原體感染，起着激活與促進的作用。
3、衣原體感染的危險因素中，第一位是合併有淋病。
沙眼衣原體感染引起的尿道炎復發者，約半數合併有淋病。
1、淋病雙球菌還對沙眼衣原體的復發起到加速作用。
2、淋病雙球菌的存在使沙眼衣原體在宮頸和尿道的複製能力提高一百倍。
