爲了對保健食品實行嚴格監管，國家食品藥品監管局保健食品化妝品監管司擬訂了《保健食品生產許可管理辦法(徵求意見稿)》(以下簡稱《辦法》)，並曾公開徵求過意見。根據反饋意見修改完善後，12月1日起再次公開徵求意見。《辦法》明確，國家對保健食品的生產實行許可制度，從事保健食品生產的企業應當依法取得保健食品生產許可證。
《辦法》指出，國家食品藥品監管局主管全國保健食品生產許可的管理。省級食品藥品監管部門負責本行政區域內保健食品生產許可管理。《保健食品生產許可證》的式樣由國家食品藥品監管局統一制定，許可證編號格式爲：省(自治區、直轄市)簡稱+食藥健生字+4位年號+4位順序編號。保健食品生產許可證有效期5年，許可證不得轉讓、塗改、出借、倒賣、出租。
