上海奕譜生物科技有限公司聯合復旦大學生物醫院研究院於文強團隊、復旦大學附屬腫瘤醫院、空軍軍醫大學附屬西京醫院團隊鑑定了又一個全癌標誌物--SIX6。這一聯合團隊在來自TCGA樣本庫的15種癌症類型的7010個樣本中發現SIX6位點的高甲基化在腫瘤中具有普遍性。進一步地，通過收集了10種常見腫瘤的678個臨牀樣本揭示SIX6的高甲基化是一個新的全癌標誌物。相關研究成果於2022年7月6日發表在Nature子刊Signal Transduction and Targeted Therapy雜誌上（IF=38.104）。
全癌標誌物將腫瘤診斷提到“前癌”階段，有望將腫瘤消滅在萌芽之中
癌症早篩關鍵在“早”，SIX6的高甲基化究竟出現得有多早？應用TCGA數據庫樣本，研究團隊發現12種腫瘤中SIX6的高甲基化均出現在I期階段，在臨牀樣本中也證實SIX6的高甲基化出現在肺癌、乳腺癌和宮頸癌的早期階段，且在癌症發展的全過程穩定存在，提示全癌標誌物SIX6可用於腫瘤全流程監控。
基於腫瘤長期演化的特徵，研究團隊想知道SIX6的高甲基化在腫瘤發展的時間軸上能否更早？對此研究團隊選取了具有階段性進展特徵的宮頸癌和胃癌樣本，發現SIX6在鱗狀上皮內病變階段就已經出現甲基化，提示應用全癌標誌物可以將宮頸癌診斷提到更早期；而高胃癌風險樣本也和胃癌一樣，呈現出更高的SIX6甲基化水平，表明SIX6的高甲基化是腫瘤進展中的一個極早期事件，可以作爲正常細胞向癌前細胞轉變的一個重要特徵，而該特徵可以將“防癌”提前到“未癌”階段。爲了進一步加以應用，科研團隊選取了無創的宮頸塗片和尿液樣本，驗證了SIX6的高甲基化出現在宮頸癌的早期——鱗狀上皮病變階段。此外，研究團隊還發現SIX6的高甲基化在區分子宮內膜癌、尿路上皮癌與相應良性疾病中具有很大優勢。
腫瘤轉移早知道、手術切沿準確判斷
目前，有20%-30%的癌症在發現時就已經進展到了中後期階段，癌細胞已擴散到附近的淋巴結、組織或器官，轉移成爲影響腫瘤治療策略和預後的關鍵因素。既然SIX6的高甲基化出現的時間更早，那麼SIX6的高甲基化能否用於腫瘤轉移的“早”判斷？研究團隊通過在乳腺癌潛在轉移階段檢測癌症淋巴結中SIX6的甲基化水平，發現陽性轉移樣本的淋巴結中SIX6也處於高甲基化狀態，而陰性樣本中則顯著降低，表明SIX6的甲基化檢測在追蹤癌症的“早期轉移”方面具有巨大的潛力和優勢，有望讓乳腺癌手術方式的選擇不再依賴於經驗，而是基於科學地決策。此外，臨牀上腫瘤切除術中，在無影燈下做到手到瘤除是每一個醫生和患者的共同心願。而腫瘤切除的手術切緣判定直接決定了腫瘤的預後，畢竟沒有人希望在手術中“瘤下點什麼”。研究團隊在胃癌手術切緣樣本的分析表明，手術切緣的 SIX6甲基化水平依然高於對照的相對正常的樣本，表明發生在分子水平的SIX6高甲基化比目前基於病理學判斷的金標準在時間上可能更早且判讀更靈敏。換一句話說，基於全癌標誌物的腫瘤切沿判定可能更加準確。建立腫瘤手術切沿的表觀遺傳學判定標準也許是未來10年腫瘤外科領域研究的重要方向，SIX6的高甲基化有望成爲這一方向上最重要的生物標誌物之一。
上海奕譜生物科技有限公司由表觀遺傳學研究領域的學者於文強教授創立，此前已發表多項全癌標誌物的重要成果，包括2019年在美國癌症研究協會官方雜誌Cancer Res （IF=13.312） 上發表全癌標誌物HIST1H4F，2021年在國際知名期刊Clinical and Translational Medicine （IF=11.492） 上發表第二個全癌標誌物PCDHGB7，2022年在國際學術期刊Frontiers in Molecular Biosciences （IF=6.113） 上揭示全癌標誌物PCDHGB7在子宮內膜癌早期篩查中的應用。SIX6是奕譜生物發現的第三個全癌標誌物。基於獨特的GPS甲基化檢測技術，奕譜生物已經開發了系列全癌標誌物檢測產品，其中TAGMe宮頸癌DNA甲基化產品已進入臨牀應用階段。（文章來源：互聯網）
