吸菸會使精子的數量減少和活動率降低，畸形精子的發生率增多。吸菸者吸入尼古丁作用於生產精子的曲細精管的生精上皮，使其生精功能減退，因而生產出來的精子數目減少，質量降低。澳大利亞的臨牀醫生研究發現：吸菸者的平均每毫升精液中的精子數0.27億個，活動率爲49.27%;每天吸20支菸以上者有6%的人每毫升精液的精子僅爲0.01億個，明顯低於受精所需的基本數目，因而不育。此外，吸菸者發生精索靜脈曲張率是不吸菸者的10倍，而這又是使精子減少，活性降低，導致不育的原因之一。
吸菸對男性致命的危害，是使男子發生陽萎。研究證實，長期吸菸者，會引起包括陰莖血管在內的人體末端小血管發生栓塞，陰莖血液供應不良而出現陽萎。陽萎造成夫妻無法過正常的性生活，不僅發生不育，還會影響夫妻感情、家庭生活和家庭和睦。1986年，比勒陀利亞大學對116名陽萎患者調查，發現108人是煙鬼。另一項調查發現，吸菸者患陽萎比不吸菸者高2倍，但戒菸後部分陽萎患者可自愈。
