男性射精疼痛可能是生殖系統損傷、生殖器炎症如精囊炎等、尿道結石及泌尿系腫瘤等因素所引起。在正常的射精的過程當中，輸精管道、前列腺以及會陰部盆底的肌肉在神經的支配下一起出現節律性的收縮，同時精液射出體外。在正常的情況下，射精後出現上述部位的輕微痠疼、脹疼，而且持續的時間很短或程度很輕，這是正常的生理現象。但是如果射精後，出現疼痛的程度很劇烈，患者不能忍受或疼痛持續的時間超過幾天以上，且仍然沒有明顯的緩解或消失，這種情況常常提示是異常的射精疼痛。
1.生殖系統損傷：生殖系統遭受了外傷或者是性生活時用力過大，導致生殖系統內部受損，在射精時就會出現射精疼痛，可能還伴有射精出血的症狀。
2.生殖器炎症：最常見的是精道的炎症，如附睾炎、前列腺炎、精囊炎、精阜炎、後尿道炎等，射精時的肌肉收縮引起疼痛。
3.尿道結石：本身存在尿道結石，射精時，尿道結石可能會移動，對尿道造成損傷，就會引起射精疼痛，可能還伴有尿頻、血尿、尿急等症狀。
4.泌尿系腫瘤：許多疾病也是可以導致男性存在射精疼痛的現象，這些疾病通常包括附睾、精囊、輸精管、前列腺或後尿道等處的腫瘤，阻塞射精通道，射精時因刺激也可引起疼痛。
在出現射精疼痛的症狀後，並且持續時間較久，自己無法確定原因，還應就醫檢查治療。
