有人以爲只要做了試管嬰兒，就一定能成功孕育一個健康寶寶，這種看法也是不切實際的。
試管嬰兒的原理看似簡單，事實上對技術要求極高，任何環節出了問題，都會影響到試管嬰兒的成功。此外，試管嬰兒只是將自然狀態下輸卵管壺腹部的受精過程以實驗室取代了，其他過程仍是在母體子宮內進行，跟自然懷孕、生育沒什麼分別，因此同樣可能發生流產、宮外孕、畸胎、死胎等併發症。大量的臨牀資料表明，試管嬰兒發生流產或胚胎停止發育的可能性比自然妊娠高，試管嬰兒有生理缺陷和體重不足的概率是普通嬰兒的兩倍。另外，爲了減少和避免多胎妊娠帶來的併發症，同時又要保證一定的成功率，衛生部規定３５歲以上婦女一次移植三個胚胎，３５歲以下一次只能移植兩個胚胎，三胞胎以上，原則上醫生要爲患者採取減胎手術，這又增加了流產或胚胎停止發育的可能性。
目前在我國，試管嬰兒的成功率約爲２０％～４０％，它除了受不孕患者年齡大小（年齡過大會導致精卵質量欠佳）、實驗室培養系統及環境條件、技術操作的熟練程度及精確性影響外，還與患者的心理、精神因素有關。同時，這種治療花費較大，平均一個週期下來，需要花費１～２萬元，這個數字也不是每個家庭都能承受的。其實有些不孕患者採用其他簡單輔助生殖技術更容易受孕，而且試管嬰兒多胎的併發症也威脅着母兒健康。
