嬰幼兒患者感染常波及下呼吸道，尤以肺炎者爲嚴重，肺炎可由流感病毒所致，或爲繼發性細菌感染，多由流感桿菌、金黃色葡萄球菌、肺炎球菌、鏈球菌所引起。
起病急，常於48小時內見高熱，持續不退；少數先中等度發熱，2～3日後漸升高，常伴嚴重喘息及發紺，甚至熱退後仍有氣喘，偶見草黃色胸腔積液。常有嘔吐、腹瀉等，嚴重時吐咖啡樣物，或伴發腸出血，均爲重症表現。有時早期可出現驚厥、昏迷、頸強直等，腦脊液壓力增高，細胞數可正常，蛋白質正常或稍增，病程中可發生偏癱，但恢復多較快。早期X線檢查，肺門兩側可見點狀或絮狀不規則陰影，後融合爲小片或塊狀陰影。
肺炎病程短至1周，長可月餘，平均住院約3周。體溫波動，肺部體徵消失緩慢。
其他尚可併發鼻炎、咽峽炎、中耳炎、喉炎、氣管支氣管炎、心肌炎、腦炎、腮腺炎等。乙型流感可併發Reye′s綜合徵。偶見化膿性關節炎、腹膜炎、神經炎、腎炎及小腿腳跟發燙疼痛等。
