1、臨牀徵象：根據患者年齡、病史、體徵可初步診斷，並對良、惡性作出估計，診斷困難時應進一步行輔助檢查。
2、超聲檢查：對卵巢腫瘤的診斷有重要意義，能測知腫塊的部位，大小、形態及性質，提示腫瘤囊性或實性，良性或惡性，並有與其它疾病鑑別。臨牀診斷符合率90%。但直徑1～2cm的實性腫瘤不易測出。
3、放射學診斷：卵巢囊腫的診斷方法有腹部平片，靜脈腎盂造影，吞鋇檢查，淋巴造影等協助診斷。電子計算機體層掃描（CT）可鑑別良、惡性腫瘤，盆腔腫塊合併腸梗阻的診斷，顯示肝、肺及腹膜後淋巴結轉移。
4、細胞學檢查：作爲穹窿穿刺，抽吸腹水作細胞學檢查，在腹腔鏡檢查或剖腹探查時，可同時在子宮直腸陷凹處吸液檢查，對惡性腫瘤的診斷有較高的準確率。
5、腹腔鏡檢查：可直接看到腫物的大體情況，可觀察整個盆腹腔，在可疑部位進行多點活檢並吸收腹液進行細胞學檢查可確定診斷及術後監護。但對巨大腫塊或粘連性腫塊患者禁忌施行，也無法觀察到腹膜後淋巴結，是爲缺點。
6、腫瘤標誌物：卵巢腫瘤和其他腫瘤一樣，能製造和釋放抗原，激素及酶等多種產物，這些物質在患者血清中可通過免疫學，生化等方法測出，稱爲腫瘤標誌物，提示體內存在某種腫瘤，這也是卵巢囊腫的診斷方法。
