污染源1
來自桶裝水的桶頸部分
因爲這是與飲水機“聰明座”最緊密接觸的地方。一些廠家對瓶頸部分不嚴格消毒，密封性能不夠，甚至使用劣質瓶蓋，工作人員在運輸過程中，一提瓶頸瓶蓋就會脫開，這樣又使水遭到二次污染。
飲水機的進水口、貯水箱內壁和冷水管道因溫度適宜極易滋生細菌，即便使用合格的桶裝水，亦是如此。若不注意清洗，會引發人體消化系統、泌尿系統的疾病。因此，建議消費者在每次換水時對飲水機進水口進行清洗，若是聰明座類型的飲水機，還可取下聰明座放入消毒櫃(低溫)或微波爐進行消毒處理，長時間不用時，應將貯水箱內的水放掉，再次使用時先用飲用水沖洗一次。
污染源2
進入飲水機的空氣
我們從飲水機裏取水的時候，從龍頭中放出多少體積的水，在此同時就會從周圍環境中補充等量體積的空氣進入桶裝水中，而室內空氣中含有大量的灰塵、細菌等有害物質，這些空氣進入飲水機桶裝水後，造成了飲用水、飲水機的二次污染。雖然現在大部分的廠家在飲水機的入氣口安裝了普通的過濾綿，一些知名品牌則安裝了光觸媒、冷觸媒等更先進的空氣過濾裝置。這樣的設計，對飲水機的二次污染起到了很好的預防作用，但需要一段時間及時清洗消毒這些裝置，否則它會成爲細菌滋生的溫牀。還有，以礦泉水爲水源的飲水機經加熱煮沸後，水中的碳酸氫根中的氫原子分解成了碳酸根離子，它們與礦泉水中的鈣、鎂等礦物質結合會生成不溶於水的沉澱物，時間一長就會沉積於飲水機水膽的底部產生積垢，不僅影響水質，而且會影響飲水機的加熱效果並容易產生噪音。
清洗飲水機DIY
目前，雖然市場上已有抑菌設計的飲水機出售或是部分飲用水廠家開始爲消費者清洗飲水機，但至關重要的是，消費者應該加強自我保護的意識。其實，家庭自行清洗飲水機並不難。
1.先打開飲水機後面的排污管，排空餘水;
2.打開所有飲水開關放空餘水;
3.將專用於飲水機消毒的去污泡騰片1片溶解在2升左右的清水裏，取用其部分消毒液擦洗飲水機內膽和蓋子的內外側;
4.其餘消毒液充盈整個腔體，待留置10-15分鐘後，再打開飲水機的開關，包括排污管和飲水開關，排盡消毒液;
5.用7-8升的清水連續沖洗飲水機整個腔體，再打開所有開關排盡沖洗液;
6.最後用消毒液擦洗開關處的後壁，這樣整個消毒過程就完成了。
