乙肝復發的原因較爲複雜，可以是單因素的，也可以是多因素，總結起來，主要有以下幾個方面。
1.勞累 慢性乙肝患者的肝臟承受負荷的能力本來就低於健康人，而勞累（包括體力勞動和腦力勞動），尤其是過度勞累可以導致肝臟負擔加重，促使乙肝病毒複製加劇，導致乙肝復發。
2.飲酒與飲食紊亂 飲酒是引起乙肝復發的最主要原因之一。酒在肝內氧化，形成有害物質乙醛，可以直接毒害肝臟。飲食方面，油膩、油炸、辛辣等食物會加重胃腸負擔，間接誘使肝炎發作。
3.濫用藥物 許多藥物有肝毒性，例如抗結核藥、口服降糖藥、解熱鎮痛藥等，服用這類藥物很容易引起乙肝復發。
4.患其他疾病 感冒、腹瀉、膽囊炎等疾病可以誘發肝功能異常，使乙肝復發，尤其是重疊感染其他類型肝炎病毒時，往往病情加重。
5.不規範使用抗病毒藥物 現有的乙肝抗病毒藥物（干擾素、拉米夫定、恩替卡韋等）都能有效抑制乙肝病毒的複製，但不能徹底清除它們。這類藥物的使用有其劑量和療程的要求，不能隨意停藥。在不規範停藥後，乙肝病毒常會再度複製、活躍。這也是目前乙肝復發的最常見原因之一。
