1、乙肝發病的規律及特點所致
乙肝發病的自然過程有其特定的規律性。我國的乙肝患者多是自幼感染了乙肝病毒。由於少兒時期機體處於免疫耐受狀態，多無症狀且肝功正常，到了青壯年時期病毒便進入免疫活動期，此時病變活動顯著且肝功異常。乙肝病毒活動期的特點是，病情呈發作——緩解——發作——緩解的規律變化，肝功時而正常，時而異常，但緩解往往是暫時的，發作是經常的。經過幾年，甚至更長一段時間的活動期後，患者將有兩個不同的歸宿：一是病變逐漸趨於靜止，不再向惡化方向發展;二是病變時休時止，肝組織纖維化程度越來越重，最終發展爲肝硬化，甚至肝癌。
2、治療不完整
有的患者使用干擾素或拉米呋啶治療乙肝時，並沒有按照正規的治療方案進行。在使用藥物期間，療效不錯，肝功正常，但在乙肝病毒指標轉陰後，就擅自停藥。有的是治療的療程不夠。這樣，要不了多久其肝功就會再次出現異常，導致病毒指標轉陽，病情復發。使用干擾素治療乙肝病需要半年以上，拉米呋啶治療也需要兩年以上。何時停藥應該聽從醫生的指導，不要自作主張。
3、治標未治本
抗病毒纔是治療乙肝的根本性措施，而其他諸如保肝、降酶、降黃等方法只解決表面問題。在轉氨酶升高期間，是許多患者進行抗病毒治療的最佳時機。但由於經濟或其他原因，他們只用了一些降酶藥，如五味子製劑(聯苯雙酯等)、甘草製劑(甘利欣、強力寧等)、山豆根製劑(肝炎靈等)。雖然其轉氨酶很快就正常了，但是停藥後，其轉氨酶很快就再次升高，從而導致病情復發。因此，治療乙肝僅僅保肝降酶實際等於揚湯止沸，不能解決根本問題。
4、用藥不當
有的乙肝患者本來只屬於病毒攜帶者或輕度的(遷延性)肝炎患者，其病情相對穩定。但此類患者病情仍反覆加重的原因主要有三點：①聽信並使用所謂的“祕方”、“偏方”，或服用一些含有肝毒性作用的中藥(雄黃、川楝子、苦楝皮等);②肝功惡化時(血清膽紅素明顯升高或發展爲活動性肝硬化等)，卻僅使用了干擾素、拉米呋啶等藥物;③不正確地使用了消炎藥、降糖藥、抗結核藥等。其實無論是中藥還是西藥，如果使用不當，都會造成藥物性肝損害，嚴重的還會導致重症肝炎的發生。
5、生活失去節律和章法
乙肝病易反覆加重的另外一個原因是，有的乙肝患者生活習慣不好，長期酗酒或長期處於勞累狀態;還有的患者心理素質差，當得知自己患了乙肝病後便憂心忡忡、不思飲食。這些異常的行爲和生活方式，都會導致乙肝病情的反覆發作。
6、自體遺傳基因所致
我國乙肝病人數目衆多，這和人口的基因易感性密不可分。有些人感染了乙肝病毒並且慢性化，以及日後演變成爲肝硬化，甚至肝癌，往往還取決於自體的遺傳因素。遺傳基因的某個或幾個片段出現的缺陷，是導致病情反覆，甚至惡化的原因之一。乙肝的自然進程是由每個人的基因特點決定的，藥物和其他因素的干預是無法使其逆轉的。
