澳大利亞政府制定了嚴格的健康標準，以防止技術移民申請成功者享受醫療保險時花費納稅人過多的金錢。對於此類以永久居民身份治療某些特殊疾病的新移民，澳大利亞規定“一人失敗，全家失敗”的原則。因此，申請人的移民申請基本上被審覈完畢後，澳大利亞移民部門會寄給申請人體檢表格，要求申請人提交體檢報告，澳大利亞本土的醫生會根據遞交的體檢報告決定申請人是否符合健康標準。通常申請人只能在澳大利亞移民部門認可的醫院進行體檢，申請人自己承擔所有體檢費用。申請人的配偶、子女必須進行體檢，即使他們不準備與主申請人一起赴澳大利亞也需這樣做。
中國被認可的醫院有17家，他們是：
北京亞洲國際緊急救援醫療中心、北京和睦家婦兒醫院、北京友誼醫院(澳大利亞)環球遠程醫療網、廣州孫逸仙紀念醫院、廣州國際旅行衛生保健中心、廣州國際SOS救援中心、上海瑞興國際醫療中心、上海市海員醫院、中國人民解放軍第455陸軍醫院(上海)、福建省省立醫院、山東省省立醫院、黑龍江省醫院、南京SOS國際醫療診所、瀋陽國際旅行衛生保健中心、中國醫科大學第二附屬醫院(瀋陽市)、新疆國際旅行衛生保健中心、重慶醫科大學附屬第一醫院。
體檢費用通常在800-950元人民幣。
體檢內容包括：
1.身高、體重、神經系統、胃腸系統、皮膚、生殖系統(包括性病跡象)、吸毒跡象、五官、視敏度。
2.循環系統，凡年齡超過16歲以上(含16歲)的申請人均需測量血壓，如果40歲以下的申請人經過反覆測量後的血壓均超過140/90，必須附上，心臟病專科醫生的診斷報告。
3.呼吸系統，如果申請人目前或者過去是肺結核病患者，必須提供患病日期、治療期限以及使用過的藥物名稱、藥力與藥量。
4.是否懷孕。
5.尿分析，如果發現尿中有蛋白質或葡萄糖，必須立即檢查。如果再次化驗結果確定含以上蛋白質或葡萄糖，並又無法作出簡單解釋的話，必須獲得並附上尿顯微鏡培養結果和敏感性、血清肌酸或葡萄糖數據。
6.B型肝炎抗原血液化驗。
7.免疫缺陷病毒化驗，如果臨牀顯示有症狀的申請人，需要進一步做酶聯免疫吸附、轉印、顆粒凝聚化驗。
8.X光胸透，如果申請人懷孕，而胸片又必須是全胸片，照射範圍會被嚴格限制，而且腹部須有保護罩。孕婦可以提出不願意拍胸片的要求，但是申請可能會推遲到生產後體檢完畢時才能完成。
如果醫生髮現肺中的疾病，會詳細說明所有胸腔異常症狀。
澳大利亞移民部門最關心的是申請人是否患有肺結核、乙型肝炎、艾滋病和過度肥胖而誘發的疾病。指定醫院的醫生對申請人體檢狀況的評價是建議性的，他們會將體檢報告和胸透照片直接寄往澳大利亞移民部門，澳大利亞移民部門再將這些材料轉往本土的醫生，他們最終決定申請人的身體狀況是否符合移民標準。如果檢查出患有上述疾病或者有任何疑問，移民部門通常會要求申請人再次體檢，再次體檢必須在原體檢醫院進行，不能更換醫院，再次體檢可以是全面的也可以是指定部位的，再次體檢通常必須在簽發再次體檢信日期後的48天內完成，澳大利亞本土的醫生需要3個月才能出結果，這就意味着如果發生再次體檢情況，移民申請將比普通情況晚3個月被批准。
再次體檢仍發現有症狀，比如乙肝爲活性、艾滋病活性等，會要求申請人進行建議性的治療，比如服用藥物、減肥，或者簽署赴澳大利亞後接受定期複查的申請，然後簽發永久居留簽證。赴澳大利亞進行定期複查是免費的。
澳大利亞政府對申請人沒有強制性的免疫規定，但是強烈希望攜帶子女的申請人在赴澳大利亞之前，對其子女進行結核病、百日咳、白喉、破傷風、小兒麻痹症、腮腺炎、麻疹、風疹的免疫預防，並隨身把免疫記錄攜帶到澳大利亞，這樣便於入境後的小孩看病。
