母嬰傳播的影響因素包括：母親艾滋病的臨牀表現，母體艾滋病病毒的負荷情況，以及母親機體的免疫狀態等等。母親的臨牀病變越重，體內T4淋巴細胞數越低，則胎兒越容易感染艾滋病病毒。母親併發機會性感染，則更能促進病毒在體內迅速繁殖，增加胎兒感染艾滋病病毒的機會。母親感染其它疾病，可以干擾胎盤的完整性，如母親患絨毛膜羊膜炎，可以助長病毒透過胎盤，其它性傳播性疾病如梅毒、下疳引起的宮頸炎或陰道潰瘍，都可以促使病毒進入宮體，或在分娩時增加母嬰傳染的機會。
母體內的病毒的濃度、含量與臨牀表現密切相關。高濃度的HIV抗原血癥患者體內的T4淋巴細胞數明顯降低，並且與病情的嚴重性相一致，這是母一嬰傳播的危險因素，也就是：母體含有艾滋病病毒的濃度越高，則傳染給孩子的機會就越大。急性感染艾滋病病毒的早期，血液中含有的病毒量較多，這時期最容易產生母嬰傳染。有報道母體內存在可以中和艾滋病病毒的中和抗體，但這種中和是否足以阻斷母嬰傳染，尚無肯定的結論。
美國每年大約有6000名感染了艾滋病病毒的孕婦，但出生的嬰兒只有20%-30%感染艾滋病病毒。俄亥俄州州立大學的邁爾克·萊爾莫爾教授認爲母體與胎兒血管的接合部位有一層細胞（滋養層），能阻斷艾滋病毒進入幼體。
