1.已有門靜脈癌栓者須酌情考慮或去除癌栓。
2.即使操作超選擇順利進行，由於高壓注射等原因，可造成誤栓，分流及可能有不可避免的微轉移產生。
3.有的病人一次治療後血管即堵塞，以致再操作困難
4.對癌塊太大者療效欠滿意。
5.肝癌主要供血依賴肝動脈，但癌塊周圍有門靜脈血供，癌細胞可以“苟安偷生”。
6.操作有一定難度，導管應超選擇進入供血動脈療效才佳，但有時進入肝動脈都很困難。而有的肝癌可多血管供血。
7.儘管超選擇進入，仍有明顯副作用，臨牀資料顯示，消化道反應最多。
8.對正常肝細胞仍有損傷，少數病人甚至出現肝機能不全。
