一般肛門溫度較口腔溫度稍高，而腋下溫度則較口腔溫度稍低(相差約0.3℃～0.5℃)。
若將體溫計置於腋窩測量體溫 (稱爲腋溫)，方法簡便，不受飲水、進食、張口呼吸、不合作等影響，但是可受到出汗及環境溫度等因素的影響，而使所測之體溫不準確，如在寒冷環境中腋溫可偏低。
體溫計放在口腔內舌下所測的溫度稱爲口溫。該測量方法較簡單，但受外界環境溫度的影響大，如剛從寒冷的環境中進入而立即測口溫，則所測之數值可偏低。有口腔炎性病變、張口呼吸、煩躁不合作或於測溫前吃過熱食、喝過熱飲料的病人，則測量口溫就不夠準確。
必要時應由肛門測量體溫(稱爲肛溫)，比較準確可靠。
測量體溫時體溫計放置的時間長短也有一定的關係，時間太短，所測得的體溫值可偏低，一般須測5分鐘以上。
