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由於甲流疫苗問世時間短，它是否對孕婦以及胎兒，特別的是否對懷孕三個月內的胎兒有副作用，這都是大家所關注的。
我國並不主張孕婦接種疫苗。主要原因是缺乏孕婦接種的臨牀資料，其接種風險仍不確定。目前衛生部正密切關注國內外疫苗臨牀試驗進展，會適時組織專家論證，提出孕婦的疫苗使用策略。
日前，衛生部、國家食品藥品監督管理局聯合下發通知，就孕產婦接種甲型H1N1流感疫苗提出指導意見。要求各級疾病預防控制中心加強孕產婦接種甲型H1N1流感疫苗後相關安全性資料的收集與分析，開展安全性監測與評價。
爲做好我國孕產婦甲型H1N1流感預防控制工作，根據WHO建議，並在參考國外現有孕產婦人羣接種甲型H1N1流感疫苗安全性資料的基礎上，經衛生部和國家食品藥品監督管理局組織專家論證，就孕產婦接種甲型H1N1流感疫苗提出指導意見。
指導意見提出，將孕產婦列爲甲型H1N1流感疫苗的重點接種人羣。妊娠各期均可進行接種。指導意見明確，孕婦接種甲流疫苗一定要遵循“知情、自願、免費”的原則，如果有意願接種甲流疫苗的孕婦，不妨去衛生部門和接種單位接種甲流疫苗。
