由於消化性潰瘍治癒停藥後複發率甚高，併發症發生率較高，而且自然病程可長達8～10年，藥物維持治療是一個重要的措施。有三種下列方案供選擇。
（1）正常維持治療：適用於反覆復發，症狀持久不緩解，合併存在多種危險因素或伴有併發症者。維持方法：選用甲氰咪胍400mg、雷尼替丁150mg或法莫替丁20mg，睡前一次服用；也可用硫糖鋁1g，每日2次口服。正規長期維持療法的理想時間尚難確定，多數主張至少維持1 ～2年，對於老年人、預期潰瘍復發可產生嚴重後果者，可終身維持治療。
（2）間歇全劑量治療：在病人出現嚴重症狀復發或內鏡證明潰瘍復發時，可給予一療程全劑量治療，據報道約有2/3以上病人可取得滿意效果。這種方法簡便易行，易爲多數病人所接受。
（3）按需治療：本法系在症狀復發時給予短程治療，症狀消失後即停藥。對有症狀者，應用短程藥物治療，目的在於控制症狀，而讓潰瘍自發癒合。事實上，有相當多的消化性潰瘍病人在症狀消失後即自動停藥。按需治療時，雖然潰瘍癒合較慢，但總的療效與全程治療並無明顯差異。下列病例不適用於本法：60歲以上，有潰瘍出血或穿孔史，每年復發2次以上，以及合併其他嚴重疾病者。
