營養學家認爲， 食物中蛋白質營養價值的高低，取決於組成蛋白質的氨基酸的種類、數量與相互間的比例。如果蛋白質中的氨基酸種類齊全，數量多，相互間的比例適當，那麼這種食物蛋白質的生物價值就高，也就是說它的營養價值高。否則，即便食物中蛋白質的含量很高，它的營養價值也不高。
豆腐的蛋白質含量雖高，但由於它的蛋白質中一種人體必需的氨基酸蛋氨酸的含量偏低，所以它的營養價值被大打折扣。如何揚長避短呢?辦法也很簡單，只需將其它動植物食品與豆腐一起烹調就可。如在豆腐中加入各種肉末，或用雞蛋裹豆腐油煎，便能更充分利用其中所含的豐富蛋白質，提高其營養檔次。
此外，豆腐雖富含鈣質，但若單食豆腐，人體對鈣的吸收利用率頗低。若爲豆腐找個含維生素D高的食物作伴同煮，藉助維生素D的作用，便可使人體對鈣的吸收率提高20多倍。例如魚頭燒豆腐，此菜不僅味道鮮美，而且搭配得非常科學。因爲魚頭內的維生素D可提高人體對豆腐中鈣質的吸收利用率。
也有專家主張將海帶或其它含碘高的海產品與豆腐爲伍。因爲豆腐中含有一種皁角甙的物資，此物雖可防止能引起動脈硬化的氧化脂質產生，卻會引起體內碘的排泄，如果長期食用易引起體內碘的缺乏。故海帶與豆腐同煮，則珠聯璧合，兩全其美了。
