1、排膿：排膿是肛瘻（常見的直腸肛管疾病之一，主要侵犯肛管，很少涉及直腸，發病率僅次於痔瘡。）的主要症狀。一般來說，新生成的瘻管排膿較多，膿汁粘稠，黃色、味臭；瘻管日久的排膿相對較少，或時有時無，稀淡如水；若膿量增加，則表示新瘻管生成。
2、瘙癢：肛門部皮膚由於膿液及其他排出物刺激，膿液不斷刺激肛周皮膚，常感覺皮膚瘙癢。肛周潮溼不適，皮膚變色、表皮脫落，纖維組織增生和增厚，有時形成溼疹。
3、便祕：硬結或瘢痕由於瘻管壁及瘻口的反覆刺激，使纖維組織增生，在管壁和瘻口形成質韌的結締組織，常表現爲瘻管周圍皮膚變色，表皮脫落，凹陷變形，觸及條索狀硬結通向肛門內。
4、腹部包塊：可能爲結腸腫瘤、腹腔內腫瘤壓迫結腸、腸結核、克羅恩病（Crohn病）或腫大的淋巴結等。左下腹捫及活動度較大的索條狀或臘腸狀腸管時，應疑及是乙狀結腸痙攣。
5、腫脹：疼痛瘻管通暢無炎症時，一般無疼痛，只有肛門局部略有腫脹感，行走時可加重，若外口封閉，瘻管存積膿液，或糞便進入瘻管，則會疼痛加重或排糞時疼痛加重，而內盲瘻則常感直腸下部和肛門部灼熱不適，排糞時疼痛加重。
6、便祕與腹瀉交替並有臍周或中、下腹部隱痛：多提示爲腸結核或腹腔內結核、克羅恩病、慢性潰瘍性結腸炎或腸易激綜合徵等病變。
7、下腹部或直腸、肛門內脹痛不適：用力解出堅硬而粗大的糞團後脹痛減輕，多提示爲直腸性便祕；左下腹隱痛不適，解出呈栗子狀的堅硬糞團後，隱痛緩解，多提示結腸痙攣或腸易激綜合徵。
8、全身症狀：多數無全身症狀，當肛瘻侵犯範圍較大較深或支管較多時，反覆炎症感染，會導致消瘦、貧血、便祕、排便困難等全身症狀。
9、劇烈腹痛、腹脹及嘔吐：常提示爲急性便祕，應考慮有腸梗阻的可能。腸梗阻時，腹部聽診多可聞及腸鳴音亢進或聞及呈高調的金屬音，至晚期可發生腸麻痹。
一旦肛門及周圍疼痛症狀，預示病情已發展到一定階段，肛門直腸疾病的延遲時間越久，就越容易讓小問題變成大問題。面對肛腸病，及時治療纔是最明智的選擇，這樣纔能有助於疾病的快速恢復。
