有50%的重症肌無力患者是以眼肌無力首要症狀發病，眼肌型重症肌無力的藥物治療方法臨牀應用比較普遍。
1、抗膽鹼酯酶藥物--代表藥物：溴吡斯的明
作用：可改善臨牀症狀，20%-40%的眼肌型重症肌無力患者能夠達到較爲滿意的療效。
副作用：消化道痙攣、腹瀉等，發生率可達34%。
注意事項：單獨使用抗膽鹼酯酶藥物不能改變眼肌型重症肌無力的自然病程，無法有效防止向全身重型症肌無力的轉化。
2、皮質類固醇類藥物--代表藥物：潑尼鬆
作用：明顯改善眼部症狀，有效地預防起病2年內向全身重型症肌無力的轉化。
副作用：粒細胞和血小板減少、轉氨酶升高、胃腸道不適、感染等。
注意事項：多數患者需常年維持低劑量用藥，當維持劑量》0.25mg/（kg.d）時，可能增加類固醇藥物的併發症，如糖尿病、骨質疏鬆、感染、胃腸道出血和高血壓等，因此臨牀用藥常使用最低有效量。
3、免疫抑制藥物--代表藥物：硫唑嘌呤
使用以上兩類藥物治療後症狀沒有改善或不能耐受皮質類固醇副作用的眼肌型重症肌無力，可參照全身型重症肌無力患者的治療方案使用免疫抑制藥物。
作用：主要通過干擾嘌呤代謝，影響T、B細胞增殖，抑制促炎細胞因子的產生，改善肌無力症狀，減少皮質類固醇藥物的用量，而且能有效防止向全身型肌無力的轉化。
副作用：粒細胞和血小板減少、轉氨酶升高、胃腸道不適、感染等。
注意事項：在抗膽鹼酯酶藥物和皮質類固醇類藥物治療後症狀沒有改善或不能耐受皮質類固醇副作用的眼肌型重症肌無力患者使用，此類藥物應在醫生指導下謹慎服用。
