顯微鏡當中的目鏡和物鏡有明顯區別，最主要的是兩者的結構不同。目鏡有兩大部分組成，並且這兩部分分別位於上端和下端，上方的透鏡就是目透鏡，主要起到是圖像放大的作用。而位於下方的透鏡則稱爲下透鏡，其能夠聚合光線在打到上方的透鏡上。這樣上方的透鏡所呈現出的影像便會更亮，同時光線也會更加均勻。下透鏡之下還裝有其他附件。
一、物鏡爲透鏡組合
物鏡的一大特色就是其本身就是一個組合，物鏡當中有許多透鏡，並且經過特殊的方式組合在一起。之所以要爲物鏡設計一個組合，是因爲單個透鏡成像有很明顯的缺點，其質量並不高。因此爲了使透鏡呈現出的圖像更加清晰，質量更高，人們設計出了物鏡這個透鏡組。
除結構不同之外，目鏡和物鏡的用處也是不同的，人們常常使用目鏡來觀察與光學系統有關的圖像。目鏡常常被應用於包括望遠鏡在內的許多儀器當中，人們使用目鏡來獲取一個物體的實像，同時再將這個實像放大，以得到更加清晰和準確的物體圖像。
二、目鏡有標記
爲了使放大效果更加明顯，目鏡往往會採用放大率較高，同時視場很大的鏡片。採用目鏡的顯微鏡主要靠目鏡來使圖像放大，因此物鏡的水平直接影響該顯微鏡成像的水平。只有物鏡的分辨率高，同時清晰程度水平高，顯微鏡已經所成的像纔會有更高的分辨率以及水平更高的清晰度。因此在使用物鏡顯微鏡的過程中，專家們會反覆調整物鏡，使其處於正常水準，由此才能得到更高質量的成像。
與物鏡相比，目鏡的一大特色就是有標記。在目鏡上往往有關於目鏡各個參數的標誌，例如其放大率如何，類別如何。並且目鏡雖然能夠起到放大作用，但不同目鏡放大的倍數是不同的，並且其材質不同，放大倍數也存在不同，學界關於目鏡的放大倍數做出了一定的規定。目鏡與物鏡結合，物鏡可以呈現清晰的圖像，而目鏡則捕捉物鏡投射的實像，再將其進行放大。與物鏡相比，目鏡的作用則更加直接，那就是放大圖像。值得注意的是，若通過物鏡人們無法判斷出一個物體的結構。那麼即便目鏡的放大倍數再多，人們也無法判斷出該物體的結構如何。
