引起精子輸送通道梗阻的原因有以下幾個方面：
（1）先天性畸形
多見的畸形是單側或兩側輸精管缺如或閉鎖，亦有附睾缺如者，單純附睾缺如較少見了。
（2）炎症
男性生殖系統的急、慢性炎症都可以引發精子運送通路管腔窄小或堵塞。多見的炎症有附睾、輸精管、精阜和前列腺等急、慢性炎症。在慢性炎症中，要尤其注意結核桿菌引發的特異性炎症。其它，還應該警惕由性病引發的生殖系統炎症。
（3）腫瘤
通常爲良性腫瘤，如附睾腺瘤樣腫瘤、平滑肌瘤和囊腫、精索腺瘤樣腫瘤、脂肪瘤、纖維瘤和囊腫、前列腺良性增生等。也有惡性腫瘤，如睾丸精原細胞瘤、胚胎癌、畸胎癌、前列腺癌、陰莖癌等。以上腫瘤有些源自精子運送通路自身，有些源自精子輸送通路周邊器官，都可導致通路管腔內堵外壓，影響精子經過。
（4）外傷
陰囊或會陰部外傷，可傷害附睾和輸精管，引發管腔部分或全部斷裂，甚至於癒合的瘢痕亦會影響精子經過。
（5）其他病症
如巨大的腹股溝疝、睾丸扭轉等亦可引發精子運送通路梗阻。
