一、卵巢腫瘤
漿膜下子宮肌瘤與實質性卵巢瘤，肌瘤有囊性變者與囊性卵巢瘤而張力很大者或卵巢瘤與子宮發生粘連者，在鑑別上存在一定困難。應詳詢月經史及腹部包塊生長速度（惡性卵巢瘤較快），仔細做婦科檢查，因腹壁緊張婦科檢查不滿意者，可藉助於麻醉藥品或止痛劑下檢查。檢查包括肛診，注意子宮體能否與腫塊分離，並可用子宮探針測量宮腔長度及方向。綜合病史、檢查加以分析。在鑑別有困難時，還可以肌肉注射催產素10單位，注射後腫塊有收縮者爲子宮肌瘤，否則爲卵巢腫瘤。大多數情況下，均可通過B超顯象檢查相區別。但有的須在手術中方能確診。
二、宮內妊娠
在妊娠前3個月，個別孕婦仍按月有少量流血，如誤認爲月經正常來潮而子宮又增大，往往錯診爲肌瘤。應詳細追問以往月經史（包括量的多少），有無生育史，年齡多大（年青的肌瘤機會更少）；還應注意有無妊娠反應。如爲妊娠，子宮增大符合月經減少的月份；肌瘤者子宮較硬。此外妊娠者外陰、陰道着紫藍色，子宮頸柔軟，乳房脹感，乳暈外可出現次暈。妊娠達4個月以後，可感胎動或聽到胎心音，用手探觸可感到子宮收縮。除病史、體徵外，還可做妊娠試驗或B超顯象檢查來鑑別。
過期流產伴有不規則陰道流血，尿妊娠試驗呈陰性反應，易誤診爲子宮肌瘤。但過期流產者有停經史，曾有妊娠反應，子宮形態正常。行B超檢查，一般可確診。必要時可行診刮鑑別。
子宮肌瘤可以合併妊娠，也必須想到，否則或漏診妊娠或誤診爲葡萄胎。以往如曾查到肌瘤，目前又有早孕史和體徵，而子宮大於停經月份，無陰道流血，孕試陽性，則診斷當無困難。但以往未經確診者，應詳細詢問月經是否過多，有無不孕史。檢查時注意子宮有無肌瘤突出，必要時可嚴密觀察。如爲葡萄胎，則停經後常有少量陰道流血，而腹部包塊在短期內長大，妊娠試驗陽性且滴定度高；B型超聲檢查葡萄胎呈雪片狀特有波型。
三、子宮腺肌病
子宮腺肌病的婦女，半數以上伴有繼發性劇烈的漸進性痛經，常有原發性或繼發性不孕。但很少超過2～3個月妊娠子宮。如伴有子宮以外子宮內膜異位症，有時可在後穹窿觸到痛性小結節。此外還可試用孕激素治療，觀察其效果，以資鑑別。但子宮肌瘤合併子宮腺肌病者也不少見，約佔肌瘤的10%左右。C超檢查更有助於鑑別。其他無症狀者，或B超未查出，則往往在手術切除標本的病理學檢查始能明確。
四、子宮肥大症
此症也引起月經過多，子宮增大，易與小的壁間肌瘤或宮腔內粘膜下肌瘤混淆。但子宮肥大症常有多產史，子宮增大均勻，無不平結節，子宮增大常在2個月妊娠左右，探測宮腔無變形，亦不感覺有腫塊存在。B超檢查見不到肌瘤結節。
五、盆腔炎性包塊
子宮附件炎塊緊密與子宮粘連常誤診爲肌瘤。但盆腔炎塊往往有大、小產後急性或亞急性感染史，繼以下腹痛、腰痛。婦科檢查腫塊往往是雙側性，較固定，壓痛明顯，而肌瘤多無壓痛。包塊雖與子宮關係密切，但仔細檢查，往往可查出正常子宮輪廓。檢查不清時，可探測子宮腔。或作B超檢查協助鑑別。
六、子宮頸癌或子宮內膜癌
較大的有蒂粘膜下肌瘤突出於陰道內伴有感染而發生潰爛，引起不規則陰道出血或大流血及惡臭排液，易與外生型子宮頸癌相混淆，在農村尤應注意。檢查時手指應輕輕繞過腫物向內觸到擴張的子宮頸口及瘤蒂，而宮頸癌則不會有蒂性感。必要時可行病理檢查鑑別。
宮腔內的粘膜下肌瘤繼發感染、出血，白帶增多，易與子宮內膜癌相混。診斷時可先B超檢查，宮腔細胞學檢查等。而後行診斷性刮宮作病理檢查。
七、子宮內翻
子宮翻出後很象垂脫於陰道內的有蒂粘膜下肌瘤。慢性內翻可引起陰道分泌物增多及月經過多。但雙合診時，除在陰道內摸到包塊外，查不到另外有子宮體存在，也查不出有瘤蒂存在。子宮探針檢查時，不能探入宮腔。有時可在腫塊表面觀察到雙側輸卵管開口。但應注意，附着在子宮底部的粘膜下肌瘤往往引起不同程度的子宮內翻。
八、子宮畸形
雙子宮或殘角子宮不伴有陰道或宮頸畸形者易誤診爲子宮肌瘤。畸形子宮一般無月經過多的改變。如年青患者在子宮旁有較硬塊物，形狀似子宮，應想到有子宮畸形的可能。常須行子宮輸卵管造影以明確診斷。自有B超檢查以來，畸形子宮易於診斷。甚至殘角子宮早期妊娠於破裂前即可明確診斷。
九、陳舊性宮外孕
陳舊性宮外孕合併盆腔血塊並與子宮附件粘連一起者，有可能誤診爲子宮肌瘤。然而，仔細詢問有無停經史，急性腹痛史及反覆腹痛發作，結合病人多伴有嚴重貧血貌，婦檢穹窿部飽滿、觸痛，盆腹腔包塊與子宮難以分開，且包塊邊界模糊、硬度不如肌瘤等特點，應想到陳舊性宮外孕的可能。此時，可行陰道後穹窿穿刺，必要時注入10ml鹽水，則可抽出陳舊性血液及小血塊則鑑別容易。B超顯象檢查可助鑑別。
