第一個誤區：病毒變異很可怕
許多患者對抗病毒治療過程中的病毒變異問題都有一些錯誤的認識，認爲病毒變異很可怕，實際上病毒變異是很正常的事情，任何生物都可以在適應外界環境的情況下發生變異。
從病毒變異至耐藥也是一個逐漸形成的過程。只要患者能夠每3個月到醫院進行一次檢查，檢測HBVDNA和肝功能，醫生會很容易地發現早期病毒變異。在醫生的指導下調整治療是完全能夠解決病毒耐藥問題的。
另外，儘管病毒變異後有可能導致肝功能反彈，但實際上在病毒變異之前的抗病毒治療中肝臟組織學已經從抗病毒治療中獲益，得到很好的修復。而且，現在已經有了可以治療耐藥病毒的藥物，只要早期發現變異，完全可以通過改變治療方案再次控制住疾病的發展。變異是所有抗病毒藥的一個共性，耐藥可防可治，只要在醫生指導下用藥就能應對耐藥問題。
第二個誤區：新藥、貴藥療效好
一些患者在治療開始的時候總是要用最好最貴的藥物，還有患者以爲選擇最新上市的藥物就是最好的。選擇治療藥物既要考慮到病情和療效，也要考慮到患者長期治療所能承受的醫藥費用，每種藥物都有各自的優缺點，不一定就要選擇最新最貴的藥物。當前已有如拉米夫定等抗病毒治療藥物，在臨牀上應用時間長，而且進入全國醫保目錄，是經濟安全並適合長期服用的。
