甲狀腺功能障礙可引起雌激素代謝障礙、卵泡刺激激素及黃體生成素分泌異常，患者主要表現爲明顯的卵巢機能不全而很少妊娠，甲狀腺功能障礙導致女性不孕的原因如下：
卵巢功能異常
臨牀研究表明，甲狀腺機能低下的患者促性腺激素的分泌呈脈衝式，但是基線水平較正常者高，從而影響了排卵。部分患者雖然體內雌激素水平正常，有正常的或者近似正常的月經週期，仍然存在不孕，可能因垂體促性腺激素效能降低或者存在抗卵巢作用，會造成不排卵，從而引起女性不孕。
自身免疫因素
在甲狀腺機能障礙伴不孕患者中，甲狀腺抗體陽性者所佔比例比較高，說明該類患者不孕可能與自身免疫功能異常有關。
代謝異常導致肥胖
在甲狀腺機能減退的患者常因代謝功能低下而導致肥胖，從而增加了女性不孕的發病率。
甲狀腺功能障礙可以影響子宮發育
動物實驗研究了甲狀腺機能低下的大鼠子宮結構，發現子宮內膜減少，肌層變薄、宮角體積減少，可見甲狀腺功能障礙可以影響子宮發育，進而造成女性不孕。
