喝豆漿的方法也要科學。
喝完全煮熟的豆漿。豆漿中的凝集素攝入過多，可能導致噁心嘔吐、消化不良甚至發生中毒；胰蛋白酶抑制劑，則會嚴重妨礙人體對蛋白質的消化吸收，嚴重時可能發生胰腺腫大。要破壞這兩種“毒物”，只有完全煮熟才做得到。此外，隔夜的豆漿也不要喝。
不要在豆漿里加雞蛋和紅糖。雞蛋中的黏液性蛋白易和豆漿中的胰蛋白酶結合，產生一種不能被人體吸收的物質，大大降低人體對營養的吸收。而紅糖裏的有機酸和豆漿中的蛋白質結合後，可產生沉澱物，也會破壞營養。
一歲半以內的嬰幼兒，最好不要喝豆漿，因爲這個年齡段的嬰幼兒腸胃功能尚未發育完全，胃內還沒有分解豆類的消化酶。
大一些的寶寶可以喝些豆漿，但要從少至多，一點一點地添加。同時，家長要注意觀察，如果寶寶出現腹脹、排氣或腹瀉，就要先控制飲用量，待寶寶腸道適應之後再逐漸增加。
儘管孩子喝豆漿有種種限制，但對於大一些的超重兒童來說，因爲熱量偏低，豆漿比起牛奶更易控制體重。同時，豆漿中以可溶性纖維爲主，豆渣中有大量不可溶纖維，這也是牛奶無法比擬的。
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