據有的資料報道，病變多年者，易轉變爲癌腫（宮頸癌、陰莖癌、肛門癌），並可有局部淋巴結轉移。尖銳溼疣的病程長短不一，有的人在數月可治癒但有的人病變持續多年，久治不愈。
有些人感染了該病毒，但處在尚未發病的“潛伏期“，此時，如與配偶性交，也有同樣的傳播性。如果孕婦被感染，疣病毒可在分娩過程中傳染給嬰兒，引起嬰兒喉部的乳頭狀癌。少女宮頸正在發育，更容易感染上乳頭瘤病毒。
尖銳溼疣反覆發作有原因
1、免疫功能。
資料表明，免疫力低下的個體如、惡性腫瘤、免疫抑制性化療和應用糖皮質激素等病人，ca的發病率及複發率均顯著增加，且疣體體積也較大。
2、年齡和性別。
年齡是ca的獨立危險因素，80%的ca發生於16～34歲的青年人，發病高峯年齡爲20～25歲。男性平均發病年齡爲22歲，女性爲19歲；男女發病比例約爲1：1.4。另一研究發現，女性年齡小於25歲是肛門生殖器疣的危險因素。
3、避孕措施。
多項研究結果表明，能阻擋hpv感染，所以堅持使用安全套可預防ca的發生。另有研究顯示，服用避孕藥婦女ca的發病率高於未服藥者。
4、飲酒。
飲酒是包括ca在內的多種性病發病和復發的危險因素。因爲飲酒影響了機體t淋巴細胞的活性，抑制了機體的免疫力。同時酒精能抑制中樞神經系統，減輕焦慮，增強性慾，增加高危性行爲，在一定程度上增加了ca的發生和復發。
5、婚姻妊娠狀況。
資料顯示，離婚、夫妻分居、喪偶、未婚者ca發病率比正常對照組高，因爲這些情況下容易發生高危性行爲。妊娠期婦女具有較高的ca發病率，且ca的複發率相對較高，這與妊娠期的內分泌功能變化有關。
6、性行爲。
研究和統計表明，有多個性伴者發生ca的機率和複發率均明顯高於單一性伴者；在一定的範圍內，性生活的年齡也是ca的危險因素，首次年齡小於19歲者，其發病率及複發率均顯著增加；男性商業性工作者是ca的高危人羣。
7、吸菸。
因爲吸菸能降低機體抵抗力，所以吸菸也是ca的獨立危險因素。研究表明，吸菸者ca的發病率比不吸菸者高3倍多，且發病率隨煙齡和日吸菸支數的增加而增加，同時吸菸能促進ca復發。
8、患其他性病。
尖銳溼疣與其他性傳播疾病如生殖器、淋病、艾滋病等密切相關，其原因一是尖銳溼疣患者多有也可導致其他性病的危險性行爲。二是一些性病的病原體破壞了黏膜屏障，使機體抵禦hpv的能力下降。
